申请人身保护令后，一般情况下双方不能继续住在一起。以下是对此问题的详细分析：
一、人身保护令的法律目的
人身保护令，也称为人身安全保护令，是法院为了保护家庭暴力受害人及其子女和特定亲属的人身安全，确保婚姻案件诉讼程序的正常进行而作出的民事裁定。其核心目的在于禁止施暴方接近、接触、骚扰受害方，从而防止暴力行为的再次发生。
二、人身保护令的具体措施
根据《中华人民共和国反家庭暴力法》的相关规定，人身保护令可以包括以下措施：
- 禁止被申请人实施家庭暴力：这是人身保护令的基本要求，旨在直接阻止施暴行为。
- 禁止被申请人骚扰、跟踪、接触申请人及其相关近亲属：这一措施进一步扩大了保护范围，确保受害方及其亲属的安全。
- 责令被申请人迁出申请人住所：在特定情况下，法院可以责令被申请人迁出申请人的住所，以彻底切断施暴方与受害方的接触机会。
三、申请人身保护令后能否继续住一起的分析
- 从法律目的角度看：人身保护令的核心目的在于保护受害方的人身安全，防止暴力行为的再次发生。如果双方继续住在一起，那么施暴方仍然有机会接近、接触受害方，从而可能再次实施暴力行为。这与人身保护令的法律目的相悖。
- 从具体措施角度看：如果法院在人身保护令中明确责令被申请人迁出申请人的住所，那么被申请人就必须遵守这一裁定，不得继续与申请人住在一起。即使法院没有明确责令迁出，但考虑到人身保护令的整体目的和措施，双方继续住在一起也不符合法律要求。
四、特殊情况下的处理
当然，也存在一些特殊情况。例如，如果双方能够证明他们已经解决了之前的矛盾，且施暴方已经采取了有效的改正措施，确保不会再对受害方实施暴力行为，那么法院可能会考虑允许双方继续住在一起。但这种情况非常罕见，且需要严格的证明和审查。
建议：
- 如果您已经申请人身保护令，为了您的安全考虑，最好不要与被申请人继续住在一起。
- 如果您对人身保护令的具体措施或执行有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。
总之，申请人身保护令后，一般情况下双方不能继续住在一起。这是为了保护受害方的人身安全，防止暴力行为的再次发生。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。