当您发现自家的林地被别人占用，而您又持有林权证时，这确实是一个需要妥善处理的问题。以下是我为您提供的详细、有条理的处理建议：

一、确认权益与收集证据

首先，您需要明确自己持有林权证，即拥有该林地的合法使用权。这是您维权的基础。接下来，您需要全面收集能够证明林地被占用的证据，包括但不限于：

• 清晰的现场照片，展示占用范围、现状；
• 视频资料，记录占用行为与现场情况；
• 林权证及相关合同文件，证明您对林地的合法使用权；
• 若有目击证人，应获取其联系方式及证言，以书面形式或录音形式保存。

二、尝试友好协商

在掌握充分证据的基础上，您可以首先尝试与占用者进行友好沟通。明确指出您的合法权益，即您持有林权证，拥有该林地的合法使用权，并要求其停止占用、恢复林地原状。沟通过程中，请保持冷静和理智，避免情绪化，同时保留相关聊天记录或通话录音作为后续可能的证据。

三、寻求基层组织调解

若直接协商无果，您可以请求当地村委会、居委会或人民调解委员会等基层组织介入调解。这些组织通常具有丰富的调解经验，能够公平公正地处理纠纷，并有助于双方达成和解协议。在调解过程中，您可以充分阐述自己的诉求和理由，同时听取对方的意见和看法，寻求双方都能接受的解决方案。

四、向林业部门投诉并申请处理

若基层组织调解未能解决问题，您可以向当地林业主管部门提交书面投诉。在投诉中，请详细说明林地被占用的情况，包括占用时间、占用范围、占用方式等，并提供相关证据材料。林业部门将依法对非法占用行为进行查处，责令占用者停止违法行为，并给予相应行政处罚。这是维护您合法权益的重要途径。

五、考虑法律途径解决

若上述方法均未能解决问题，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。具体来说，您可以向人民法院提起民事诉讼，要求占用者停止侵权行为、赔偿经济损失并恢复林地原状。在诉讼过程中，您需要提交充分的证据来证明自己的诉求和理由。同时，您也可以咨询专业律师的意见，以获取更全面的法律支持和帮助。

六、注意事项

在整个维权过程中，请您务必保持冷静和理智，避免与他人发生冲突。法律程序可能需要一定时间，请您做好心理准备并积极配合相关部门的工作。同时，如需进一步法律帮助或咨询，请及时寻求专业律师的支持。

综上所述，面对林地被占用的问题，您应首先收集证据、确认权益；然后尝试友好协商；协商不成时，可寻求基层组织调解或向林业部门投诉；必要时，通过法律途径维护自身合法权益。相信法律一定会保护您的合法权益不受侵犯。