结论是：在不知情的情况下使用了5000块涉案资金，且检察院已让退还，一般情况下检察院不会因此追诉，但具体还需结合案件细节和法律规定来判断。以下是从不同角度进行的分析：
一、不知情情况下的法律责任
主观要件缺失：在刑事法律中，构成犯罪通常需要具备主观要件，即故意或过失。如果您在不知情的情况下使用了涉案资金，那么您主观上并没有犯罪的故意或过失，因此从主观要件上来看，您并不构成犯罪。
客观行为分析：虽然您使用了涉案资金，但这一行为是在不知情的情况下发生的。如果检察院能够确认您确实不知情，并且没有其他证据表明您与涉案资金有其他非法关联，那么检察院通常不会因此对您进行追诉。
二、检察院的处理方式
退还涉案资金：检察院让您退还涉案资金，这通常是作为处理此类案件的一种方式。退还资金可以视为对受害者的一种补偿，也是您表明自己没有非法占有目的的一种方式。
不追诉的可能性：在您退还了涉案资金，并且检察院确认您不知情的情况下，检察院通常会考虑不对您进行追诉。因为追诉您并不符合刑事法律的立法目的，也不利于社会的和谐稳定。
三、可能存在的例外情况
证据变化：如果在后续的调查中，检察院发现了新的证据，表明您实际上知情或者与涉案资金有其他非法关联，那么检察院可能会重新考虑对您进行追诉。
法律变化：虽然这种情况比较少见，但如果相关法律发生了变化，对不知情情况下使用涉案资金的行为有了新的规定，那么也可能影响检察院的处理方式。
四、建议与注意事项
保留证据：为了证明自己确实不知情，您可以保留与涉案资金无关的所有证据，如交易记录、聊天记录等。这些证据在后续可能需要的法律程序中可能会起到关键作用。
配合调查：如果检察院需要您配合调查，您应该积极配合，提供真实、准确的信息。这有助于检察院更快地查明事实真相，作出公正的处理决定。
咨询专业律师：虽然我已经给出了上述分析，但每个案件的具体情况都有所不同。如果您对自己的情况还有疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况给出更详细的法律建议。
最后需要强调的是，法律问题具有复杂性和个体差异性，我的分析只是基于一般情况和法律规定进行的。如果您遇到了具体的法律问题，最好直接向我咨询，以便得到更准确、更全面的法律帮助。