交通肇事罪案件中，检察院三个月未通知的情况可能由多种因素导致，以下从不同角度进行分析：
案件复杂程度：
- 交通肇事罪案件若涉及多方责任、重大伤亡或财产损失，或者案件事实存在争议，如事故责任划分不明确、证据收集困难等，检察院可能需要更多时间进行审查。这种情况下，三个月未通知并不罕见，因为检察院需要确保案件事实清楚、证据确凿，以作出公正的起诉或不起诉决定。
补充侦查需求：
- 在审查过程中，检察院可能发现案件证据不足或存在矛盾，需要公安机关进行补充侦查。补充侦查的时间不计入审查起诉期限，因此可能导致整体审查时间延长。如果案件经历了补充侦查，那么三个月未通知可能是正常的程序流程。
程序性延迟：
- 检察院在处理案件时，可能因内部流程、人员调配或案件积压等原因导致处理速度放缓。虽然这种情况不常见，但也不能完全排除。此外，如果案件涉及多个部门或需要跨地区协调，也可能导致处理时间延长。
不起诉决定的可能性：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，检察院在审查起诉阶段有权作出不起诉决定。如果检察院认为犯罪嫌疑人情节轻微、危害不大，或者证据不足无法证明犯罪事实，可能会决定不起诉。在这种情况下，检察院可能不会及时通知犯罪嫌疑人或其家属，而是先进行内部讨论和审批。但通常，检察院会在作出决定后尽快通知相关方。
针对您的情况，我建议您采取以下措施：
- 主动联系检察院：您可以亲自或委托律师前往检察院，了解案件进展情况。检察院有义务向您或您的律师提供案件的基本信息和处理进度。
- 保持通讯畅通：确保您的联系方式准确无误，并保持通讯畅通，以便检察院在需要时能够及时联系到您。
- 耐心等待并关注进展：如果案件确实复杂或需要补充侦查，那么等待一段时间是必要的。但您可以定期向检察院询问案件进展，以保持对案件的关注。
若您对检察院的处理有异议或认为自己的权益受到侵害，您可以考虑以下法律途径：
- 申请复议或申诉：如果您认为检察院的处理决定存在错误或不当，您可以依法申请复议或申诉。
- 寻求法律援助：如果您在处理案件过程中遇到困难或需要法律帮助，您可以寻求法律援助机构的支持或委托专业律师代理。
最后，我需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，因此处理时间也会有所差异。如果您对案件进展有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。