眩晕查因未明确的情况下申领驾驶证，其合法性需分情况讨论：

1. 若眩晕未影响驾驶安全且符合体检标准：

   • 根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，申领驾驶证需通过身体条件检查，确保无妨碍安全驾驶的疾病。若眩晕原因虽未明确，但经体检确认不影响驾驶安全（如未出现频繁眩晕、意识丧失等症状），且符合其他申领条件，则申领驾驶证是合法的。
   • 法律建议：在此情况下，建议申领人保留体检报告及相关医疗证明，以备后续核查。

2. 若眩晕可能影响驾驶安全且未通过体检：

   • 若眩晕症状频繁发作，或经体检确认存在可能影响驾驶安全的疾病（如癫痫、美尼尔氏综合征等），则不符合申领驾驶证的条件。此时申领驾驶证是违法的，且可能面临驾驶证被吊销、罚款等法律后果。
   • 法律后果：根据《道路交通安全法》，未取得机动车驾驶证、机动车驾驶证被吊销或者机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处十五日以下拘留。

3. 特殊情况：隐瞒病情申领驾驶证：

   • 若申领人明知自身存在可能影响驾驶安全的疾病，却故意隐瞒病情申领驾驶证，则构成违法行为。一旦发生交通事故，且事故与隐瞒的病情有关，申领人可能需承担更大的法律责任。
   • 法律建议：申领人应如实告知体检机构自身健康状况，避免因隐瞒病情而引发法律风险。

综合建议：

• 在申领驾驶证前，建议申领人进行全面的身体检查，确保无妨碍安全驾驶的疾病。
• 若眩晕症状持续存在或加重，应及时就医并查明原因，以便评估是否适合驾驶。
• 如有任何疑问或担忧，建议咨询专业医生或法律人士，以确保自身行为合法合规。

进一步思考：

• 眩晕查因未明确时，申领人应谨慎对待驾驶证申领问题，避免因一时疏忽而引发不必要的法律风险。
• 公安机关交通管理部门在审批驾驶证申领时，也应严格把关，确保申领人符合驾驶安全要求。