针对您提出的“父亲全款买的房子，房产证写的儿子名字，如何写协议”的问题，以下是一份详细的协议撰写指南及示例，旨在帮助您明确双方权益，避免未来可能出现的纠纷。

协议撰写指南

1. 明确协议目的：

   • 协议应明确指出，虽然房产证上登记的是儿子的名字，但实际出资人为父亲，旨在明确房屋的实际归属和出资情况。

2. 详细条款设定：

   • 出资情况说明：清晰阐述父亲全款购买房屋的事实，包括购房时间、地点、金额等。
   • 房屋归属声明：明确房屋的实际所有权归父亲所有，儿子仅为名义上的产权人。
   • 使用与处分限制：规定儿子未经父亲书面同意，不得擅自处分房屋（如出售、抵押、赠与等）。
   • 装修与修缮规定：若儿子需对房屋进行装修或修缮，应事先征得父亲同意，并可能需承担相应费用。
   • 争议解决方式：约定双方发生争议时的解决途径，如友好协商、调解或诉讼等。

3. 法律合规性：

   • 确保协议内容符合相关法律法规，不违反公序良俗。
   • 协议应由双方自愿签署，无强迫或欺诈行为。

4. 签署与保管：

   • 协议应一式两份，双方各执一份，具有同等法律效力。
   • 签署时，双方应亲自到场，并在协议上签字、盖章（如适用）并注明日期。

协议示例

房屋归属协议

甲方（父亲方）：[父亲姓名]
身份证号：[父亲身份证号]

乙方（儿子方）：[儿子姓名]
身份证号：[儿子身份证号]

鉴于甲方全额出资购买了位于[具体地址]的房产，且该房产登记在乙方名下，为明确双方权益，经友好协商，达成如下协议：

1. 出资情况：甲方于[购房日期]全额支付了购房款人民币[金额]元，用于购买上述房产。

2. 房屋归属：该房屋的实际所有权归甲方所有，乙方仅为名义上的产权人，不享有房屋的实际权益。

3. 使用与处分限制：未经甲方书面同意，乙方不得擅自处分该房屋，包括但不限于出售、抵押、赠与等行为。

4. 装修与修缮：若乙方需对房屋进行装修或修缮，应事先征得甲方同意，并可能需承担相应费用。具体费用及装修/修缮方案需经双方协商确定。

5. 争议解决：如双方在本协议履行过程中发生争议，应首先通过友好协商解决；协商不成的，可向有管辖权的人民法院提起诉讼。

6. 其他：本协议未尽事宜，由双方另行协商补充。本协议一式两份，甲乙双方各执一份，自双方签字之日起生效。

甲方（签字）：________________
日期：________________

乙方（签字）：________________
日期：________________

注意事项

• 在撰写和签署协议前，建议咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。
• 协议签署后，双方应妥善保管各自的协议副本，以备不时之需。
• 如未来房屋情况发生变化（如拆迁、出售等），双方应按照协议约定和法律法规进行处置。

希望这份指南和示例能帮助您撰写一份清晰、详细、有深度的房屋归属协议，以保障双方的合法权益。