当遇到集体土地被个人非法占用的情况时，我们可以采取一系列综合措施来有效解决问题，确保集体土地的合法权益得到维护。以下是一个详细且深入的处理流程：

一、明确占用行为的合法性

首先，我们需要确认该占用行为是否经过了合法审批，是否违反了土地管理法规。如果未经合法审批或违反了相关法规，那么该占用行为就属于非法。

二、双方协商解决

适用情况：当占用情节较轻，且双方能够友好沟通时，可以优先考虑通过协商来解决问题。

具体操作：

• 集体应派出代表与占用者进行沟通，明确指出其不当行为，并要求其停止占用、恢复土地原状。
• 双方可以协商具体的解决方案，如归还土地的时间、赔偿方式等，并签订书面协议以确保履行。

三、申请调解或仲裁

如果协商无果，我们可以考虑向当地村委会、乡镇人民政府等机构申请调解，以促成和解。此外，根据《中华人民共和国农村土地承包法》，当事人还可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，以解决土地纠纷。

四、向相关部门举报或投诉

确定管辖部门：一般来说，我们应该向县级以上人民政府自然资源主管部门或乡镇人民政府进行举报。

提交材料：

• 详细说明占用情况，包括时间、地点、面积、方式以及对集体的损害。
• 附上相关证据，如土地权属证明、现场照片、证人证言等。

等待调查处理：相关部门将进行调查核实，并根据调查结果依法作出处理决定，如责令改正、退还土地、罚款等。

五、提起民事诉讼

适用情况：当协商、调解、仲裁以及行政处理均无效时，集体可以考虑提起民事诉讼。

具体操作：

• 委托律师准备诉讼材料，包括起诉状、证据清单等。
• 向法院提起诉讼，并在诉讼过程中充分举证证明集体对土地的合法权益以及被告的侵权行为。
• 争取法院支持诉讼请求，要求停止侵权、归还土地并赔偿损失。

六、追究刑事责任

适用情况：如果占用行为情节严重，构成了犯罪（如非法占用农用地罪），那么就必须追究刑事责任。

具体操作：

• 集体应向公安机关报案，并提供案件线索和证据材料。
• 公安机关将进行侦查，并将案件移送检察机关审查起诉。
• 最终由法院依法审判，对犯罪者进行刑事处罚。

七、加强土地管理

为了防止类似问题再次发生，集体应加强土地管理，建立健全管理制度。这包括定期巡查土地、及时发现并制止私占土地行为等。

综上所述，解决集体土地被个人非法占用的问题需要综合运用多种手段，从协商到法律途径，再到加强管理。只有这样，我们才能确保集体土地的合法权益得到有效保护。在整个处理过程中，我们一定要记得收集和保留好相关的证据，以有力地支持我们的主张和诉求。