公司有权利让离职员工签保密协议，且这一行为通常是合法的。以下从多个角度进行详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对于负有保密义务的劳动者，用人单位还可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。这一法律规定为公司要求离职员工签订保密协议提供了明确的法律依据。

二、合理性分析

1. 保护商业秘密：商业秘密是企业的重要资产，包括技术方案、客户名单、营销策略等。员工在职期间可能接触到这些机密信息，离职后若随意泄露，会给公司造成重大损失。因此，公司通过签订保密协议，可以保护自身的商业秘密和竞争优势。

2. 员工义务：员工在在职期间有义务保守公司的商业秘密，这一义务并不因离职而自动解除。签订保密协议可以进一步明确员工的保密义务，确保员工在离职后继续履行保密责任。

三、签订保密协议的注意事项

1. 协议内容明确：保密协议应明确保密范围、期限、双方的权利义务等关键条款。保密范围应具体明确，避免过于宽泛或模糊；保密期限应根据实际情况合理设定，不宜过长或过短；双方的权利义务应平衡，既要保护公司的商业秘密，又要保障员工的合法权益。

2. 经济补偿：根据法律规定，若保密协议中约定了竞业限制条款，公司应在竞业限制期限内给予员工经济补偿。若公司仅要求员工履行保密义务，却不给予相应补偿，员工有权要求公司给予补偿，或在一定条件下主张协议无效。

四、不合法的情形及应对措施

1. 不合法的情形：若保密协议条款显失公平，如无限扩大保密范围、不合理延长保密期限，又不给予员工合理补偿，公司以此要挟不办离职手续则不合法。根据相关法律，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明。公司以不签保密协议为由拒绝办理离职手续，属于违法行为。

2. 应对措施：员工遇到这种情况，可先与公司协商，要求明确保密协议内容并给予合理补偿。协商不成，员工有权向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁维护自身权益。

建议：公司在要求离职员工签订保密协议时，应确保协议内容合法、合理，并给予员工相应的经济补偿。员工在签署保密协议前，也应仔细审查协议条款，明确自己的权利和义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。