核心结论：两兄弟中，父亲若要将一套小产权房给其中一个儿子，需通过书面协议明确各方权利义务，协议内容需合法合规且符合实际情况。以下是从不同角度给出的协议撰写建议及注意事项。

1. 协议主体与目的明确

• 协议主体：协议应明确列出父亲（赠与人）、接受赠与的儿子（受赠人）以及另一位儿子（如涉及知情或放弃权利的情况）的姓名、身份证号等基本信息。
• 目的阐述：简要说明协议的目的，即父亲自愿将某套小产权房赠与给指定儿子，并明确该赠与行为不涉及其他经济纠纷或法律责任。

2. 房产信息详细描述

• 房产位置：准确描述房产的具体地址，包括省、市、区、街道、门牌号等。
• 房产状况：说明房产的建筑面积、结构、楼层、朝向等基本信息，以及当前的使用状况（如自住、出租等）。
• 产权证明：由于是小产权房，需说明该房产的产权来源及现状，如是否属于集体土地上的自建房、是否取得过相关部门的批准或认可等。

3. 赠与条款具体明确

• 赠与意愿：明确父亲自愿将上述房产赠与给指定儿子，且该赠与行为是真实、有效的。
• 赠与条件：如有特殊条件（如受赠人需承担赡养义务、不得擅自转让等），应在协议中明确列出。
• 交付时间与方式：约定房产的交付时间、方式及交付时的状态（如是否包含家具、电器等）。

4. 权利义务与责任划分

• 受赠人权利：明确受赠人取得房产后的所有权、使用权、收益权等。
• 受赠人义务：如受赠人需承担的房产维护、税费缴纳等义务。
• 赠与人责任：说明赠与人对房产的瑕疵担保责任，以及因房产问题可能引发的法律责任。
• 其他儿子权益：如另一位儿子对房产有知情权或放弃权利的声明，也应在协议中明确。

5. 违约责任与争议解决

• 违约责任：约定如任何一方违反协议约定，应承担的违约责任及赔偿方式。
• 争议解决：明确争议解决的方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等，并约定具体的管辖法院或仲裁机构。

6. 协议生效与变更

• 生效条件：约定协议生效的条件，如双方签字盖章、见证人见证等。
• 协议变更：如需变更协议内容，应明确变更的程序及方式。

注意事项：

• 由于小产权房的特殊性，其产权可能不受法律完全保护，因此在撰写协议时需特别注意风险揭示和免责条款。
• 协议应尽可能详细、明确，避免使用模糊或歧义的表述。
• 协议签署前，建议双方对协议内容进行充分沟通和协商，确保各方对协议内容无异议。
• 协议签署后，建议进行公证或见证，以增强协议的法律效力。

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