未办理施工许可证擅自施工的，将面临责令停止施工、限期改正以及罚款等处罚。具体来说，根据相关法律法规，处罚措施主要包括以下几个方面：

1. 责令停止施工与限期改正：

   • 根据《中华人民共和国建筑法》第六十四条，未取得施工许可证或者开工报告未经批准擅自施工的，相关部门将责令停止施工，并要求限期改正。这是为了确保工程建设的合法性和安全性，防止因违规施工而引发的各种问题。

2. 罚款：

   • 依据《建筑工程施工许可管理办法》第十二条，对于未取得施工许可证或者为规避办理施工许可证将工程项目分解后擅自施工的，由有管辖权的发证机关责令停止施工，限期改正，并对建设单位处工程合同价款1%以上2%以下的罚款；对施工单位处3万元以下的罚款。罚款的具体数额将根据工程合同价款或违规情节的严重程度来决定。

3. 其他可能的处罚：

   • 在某些情况下，如果违规施工行为情节严重，还可能面临更严厉的处罚，如工程拆除、吊销营业执照等。这些处罚措施旨在进一步强化对违规施工行为的打击力度，维护建筑市场的秩序和安全。

法律建议：

• 为了避免不必要的法律风险和经济损失，建设单位和施工单位应严格遵守相关法律法规，按照规定程序申请施工许可证。在申请施工许可证时，应确保提交的材料真实、完整、有效，并积极配合相关部门的审查和监督工作。
• 如果已经发生了未办理施工许可证擅自施工的情况，应立即停止施工，并主动向相关部门报告情况，积极配合调查和处理工作。同时，应尽快补办施工许可证，确保工程建设的合法性和安全性。

实际案例参考：

• 例如，在某污水处理项目某标段未及时办理施工许可证擅自施工的案例中，相关部门依据《建筑工程施工许可管理办法》第十二条的规定，对该项目施工单位进行了行政处罚，处罚金额为壹万伍仟元，并责令停止施工、限期改正。这一案例充分说明了未办理施工许可证擅自施工的严重性和可能面临的法律后果。

综上所述，未办理施工许可证擅自施工是严重的违法行为，将面临严厉的法律处罚。因此，各建设单位和施工单位应高度重视施工许可证的申请与办理工作，确保工程项目的合法合规进行。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。