针对危运车辆连续多次超速且整改不到位的情况，处罚措施通常依据相关法律法规以及行业监管要求来执行。以下是对此类情况可能采取的处罚措施的详细解答：

一、法律法规依据

1. 《道路运输车辆动态监督管理办法》：该办法明确规定了道路运输车辆动态监控的相关要求，包括超速行为的监控、记录和干预。对于未履行纠正处理职责的企业，将依法进行处罚。

2. 《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例：这些法律法规对超速行为有明确的处罚规定，包括罚款、扣分、吊销驾驶证等。对于危运车辆，由于其运输的特殊性，处罚可能更为严厉。

二、处罚措施

1. 对企业主体的处罚：

   • 罚款：根据超速行为的严重程度和整改情况，对企业处以一定数额的罚款。
   • 停业整顿：对于连续多次超速且整改不到位的企业，可能面临停业整顿的处罚，直至整改合格。
   • 吊销经营许可：在极端情况下，如果企业长期忽视超速问题，且整改无效，可能面临吊销道路运输经营许可的严厉处罚。

2. 对车辆和驾驶员的处罚：

   • 车辆停运：对于超速严重的危运车辆，可能面临停运的处罚，直至问题解决。
   • 驾驶员扣分和罚款：根据超速的具体情况，对驾驶员进行扣分和罚款处理。如果超速行为严重，还可能面临吊销驾驶证的处罚。
   • 列入黑名单：对于多次超速且整改不到位的驾驶员，可能被列入行业黑名单，限制其从事危运驾驶工作。

3. 加强监管和整改要求：

   • 动态监控系统强化：要求企业加强动态监控系统的建设和管理，确保能够实时、准确地监控车辆行驶状态，及时发现并纠正超速行为。
   • 定期报告和整改：要求企业定期向监管部门报告超速行为的整改情况，确保整改措施得到有效执行。
   • 培训和教育：加强对驾驶员的培训和教育，提高其安全意识和驾驶技能，减少超速行为的发生。

三、实际案例参考

以您提供的参考信息为例，交通运输部检查指导组在督查中发现某危货运输车辆存在长期超速行为，且企业未履行纠正处理职责。针对这种情况，检查指导组不仅指出了企业主体责任落实不力的问题，还强调了监管机制的漏洞。在实际操作中，监管部门可能会根据这些情况对企业进行罚款、停业整顿等处罚，并要求企业加强动态监控系统的建设和管理，确保超速行为得到及时纠正。

四、建议与措施

1. 企业应自查自纠：企业应定期对危运车辆进行安全检查，及时发现并纠正超速等违规行为。
2. 加强驾驶员培训：提高驾驶员的安全意识和驾驶技能，减少因人为因素导致的超速行为。
3. 完善监管机制：监管部门应加强对危运车辆的动态监控和日常检查，确保企业落实主体责任，及时整改超速等违规行为。

综上所述，对于危运车辆连续多次超速且整改不到位的情况，处罚措施将依据相关法律法规和行业监管要求来执行，包括对企业、车辆和驾驶员的处罚以及加强监管和整改要求。