针对您提出的“电动无牌摩托车闯红灯撞了无牌无证摩托车，对方不愿意赔偿的话应该怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，无论摩托车是否有牌有证，发生交通事故后，责任方都应当承担相应的赔偿责任。这是基于《道路交通安全法》以及相关民事法律法规的规定。

针对您的情况，如果对方不愿意赔偿，您可以采取以下步骤来维护自己的合法权益：

1. 申请调解：

   • 您可以先尝试与对方进行协商，看是否能够达成赔偿协议。
   • 如果协商无果，您可以向当地的交通事故调解委员会或者公安机关交通管理部门申请调解。这些机构会组织双方进行调解，并尝试达成一个双方都能接受的赔偿方案。

2. 提起诉讼：

   • 如果调解不成，或者对方拒绝参与调解，您可以直接向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。
   • 在提起诉讼前，您需要准备好起诉状以及与案件相关的证据材料，如事故现场照片、交警出具的事故责任认定书、医疗费用发票等。
   • 起诉状应当详细陈述事故经过、责任划分以及您的赔偿请求。如果您书写起诉状确有困难，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。

3. 法院审理与判决：

   • 人民法院在收到起诉状后，会在规定的时间内将起诉状副本发送给被告，并要求被告提出答辩状。
   • 法院会安排开庭审理，双方可以在法庭上陈述自己的观点和证据。
   • 法院会根据事实和法律规定，作出判决，确定责任方和赔偿金额。

4. 执行判决：

   • 如果判决生效后，对方仍然不愿意履行赔偿义务，您可以向法院申请强制执行。
   • 法院会采取相应的执行措施，如查封、扣押、拍卖对方的财产等，以确保您的合法权益得到实现。

此外，还需要提醒您的是，无牌无证的摩托车在道路上行驶是违法的，这不仅可能面临交通管理部门的处罚，还可能在发生交通事故时承担更大的责任。因此，建议您在今后的出行中，务必遵守交通法规，确保自己的安全和他人的安全。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或者需要进一步的法律帮助，请随时咨询。