结论是：小区停车收费超时付了钱，出门再回来又重新计费是否合理，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、从合同角度分析
若停车收费规则明确规定了计费方式：
- 如果小区停车场的收费规则中明确规定了“每次进出均重新计费”或类似条款，并且这一规则在车主进入停车场时已经以合理方式（如显著位置张贴公告、入口处明确告知等）告知了车主，那么车主在超时付费后出门再回来又重新计费，是符合合同约定的，因此是合理的。
- 法律依据：根据《民法典》的相关规定，当事人之间可以约定合同的内容，包括计费方式等。只要这种约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是有效的。
若停车收费规则未明确规定计费方式：
- 如果小区停车场的收费规则中没有明确规定“每次进出均重新计费”，或者规定不明确，那么车主在超时付费后出门再回来又重新计费，可能缺乏合同依据，因此可能不合理。
- 建议：在这种情况下，车主可以与小区物业公司进行协商，要求其提供合理的计费依据。如果协商无果，车主可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。
二、从公平合理角度分析
若重新计费符合公平合理原则：
- 如果小区停车场因为资源有限、管理成本高等原因，需要采取“每次进出均重新计费”的方式来确保停车场的正常运营和公平使用，那么这种计费方式在符合合同约定的前提下，也是公平合理的。
若重新计费违背公平合理原则：
- 如果小区停车场在车主已经支付了超时费用后，又无正当理由地要求车主再次支付费用，这种计费方式可能违背了公平合理原则。
- 法律依据：根据《消费者权益保护法》的相关规定，经营者不得以格式条款、通知、声明、店堂告示等方式，作出排除或者限制消费者权利、减轻或者免除经营者责任、加重消费者责任等对消费者不公平、不合理的规定。
三、实际操作建议
- 车主方面：在进入小区停车场前，应仔细阅读并了解停车场的收费规则，包括计费方式、超时费用等。如果对规则有疑问或不明确的地方，应及时向小区物业公司咨询并要求其解释清楚。
- 小区物业公司方面：应制定明确、合理的停车收费规则，并以合理方式告知车主。同时，应确保计费方式的公平性和合理性，避免因为计费问题而引发与车主之间的纠纷。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。