起诉费被退回，通常是因为您的案件符合了某些特定的条件，导致法院决定免除或退还您已交纳的诉讼费。具体来说，这种情况可能发生在以下几种场景中：

一、当事人自行和解并申请撤诉

根据《最高人民法院关于人民法院进一步深化多元化纠纷解决机制改革的意见》的相关规定，如果当事人在诉讼过程中自行达成和解，并因此申请撤诉，那么该案件就符合免交案件受理费的条件。例如，在您提到的运输合同纠纷案例中，原告公司与被告公司自行达成和解后申请撤诉，法院就根据这一规定，将原告已交纳的诉讼费全额退还。

二、法院委托调解并达成协议

除了当事人自行和解外，如果当事人接受了法院的委托调解，并在调解过程中达成了协议，那么法院也可能根据具体情况适当减免诉讼费用。这是法院为了鼓励当事人通过调解方式解决纠纷，降低诉讼成本而采取的一种措施。

三、其他特殊情况

除了上述两种情况外，还有一些其他特殊情况也可能导致起诉费被退回。例如，如果案件在立案后发现不符合起诉条件或者存在其他应当驳回起诉的情形，法院可能会裁定驳回起诉，并退还原告已交纳的诉讼费。

退回起诉费的意义

起诉费被退回不仅减轻了当事人的经济负担，还体现了法院在多元化纠纷解决机制中的积极作用。通过鼓励当事人自行协商、接受调解等方式解决纠纷，法院能够更高效地配置司法资源，降低诉讼成本，实现多方共赢的局面。

建议您

如果您收到了起诉费被退回的通知，建议您仔细阅读通知内容，了解退回的具体原因和依据。如果您对退回决定有异议或者需要进一步的解释和说明，可以及时联系法院或者咨询专业的法律人士。

总的来说，起诉费被退回是法院根据相关规定和案件具体情况作出的决定，旨在鼓励当事人通过和解、调解等方式解决纠纷，降低诉讼成本。希望这个解答能够帮助您更好地理解起诉费被退回的原因和意义。