如果钱已经还了但手写欠条没拿回来，首先不要过于慌张，可采取以下措施来保障自己的权益：

一、保留还款证据

1. 转账记录：如果是通过银行转账、微信支付、支付宝等电子方式还款，务必保留好转账记录。这些记录应包含转账时间、金额、双方账户信息等关键要素，是证明还款事实的有力证据。
2. 现金还款证据：若采用现金还款，应尽量寻找第三人在场见证，并让见证人出具书面证言。同时，可考虑录音录像以记录还款过程，包括时间、地点、金额及双方确认债务已清偿的对话内容。
3. 收条或确认函：要求债权人出具收条或确认函，明确写明债务人姓名、还款金额、还款日期及所还债务的具体事项，并由债权人签字确认。这是最直接且有效的证据，能够证明你已经履行了还款义务。

二、与债权人积极沟通

1. 友好协商：尽快与债权人取得联系，以诚恳的态度说明款项已还清的情况，并请求对方归还或销毁欠条。沟通方式可以选择面对面、电话、微信等，但需确保保留相关沟通记录，以备不时之需。
2. 应对拒绝：若债权人拒绝归还欠条且主张债务未偿还，而你有足够的还款证据，不必过于担心。在诉讼中，法院会依据双方提供的证据进行判定。只要你能证明已经还款，即使欠条在对方手中，也不会承担再次还款的责任。

三、特殊情况处理

1. 涉及担保：如果债务有担保人，还款后需及时通知担保人，并确保其知晓债务已清偿，以免担保人承担不必要的责任。
2. 欠条涉诉：若债权人在还款后仍持欠条起诉要求再次还款，应积极应诉，并向法院提供上述收集的还款证据以证明债务已清偿。

四、法律救济途径

1. 提起诉讼：如果债权人恶意不归还欠条，并以欠条为依据再次索债，你可以通过法律途径维护自己的权益。具体做法包括向法院提起诉讼，要求确认债务已消灭，并要求债权人承担因恶意行为造成的损失。
2. 注意诉讼时效：一般民事纠纷的诉讼时效为三年，从知道或应当知道权利受到损害及义务人之日起计算。因此，在发现债权人可能恶意索债时，应及时采取行动，以免错过诉讼时效。

五、预防未来纠纷

1. 谨慎交易：为避免类似情况再次发生，建议在未来的交易中更加谨慎。在还款时，务必确保同时收回欠条或获得明确的收款确认。
2. 签订书面协议：可考虑在交易前签订书面协议，明确双方权利义务及还款流程。这样可以在发生纠纷时，有明确的依据来维护自己的权益。

总结与建议：面对钱已归还但欠条未拿回的情况，关键在于保留充分的还款证据并与债权人积极沟通。如遇纠纷，应及时通过法律途径维护自身权益。同时，也应加强风险意识，预防未来类似纠纷的发生。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。