婚内协议约定财产归女方所有，该财产在协议有效的情况下仍属于婚内财产，但具体归属需依据协议内容及法律规定来确定。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、协议有效且合法的情况
协议内容合法：根据《中华人民共和国民法典》第一千零六十五条，男女双方可以约定婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产归各自所有、共同所有或者部分各自所有、部分共同所有。因此，若婚内协议明确约定财产归女方所有，且该约定是双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫等违法情形，那么这样的约定是具有法律效力的。
财产归属确定：在协议有效且合法的前提下，婚内协议约定的财产归女方所有，即意味着这些财产在法律上被视为女方的个人财产。然而，这并不改变这些财产原本属于婚内财产的性质，只是其归属发生了变化。
二、协议存在问题的情况
协议显失公平：如果协议内容明显不公平，例如男方是在重大误解的情况下，或者是受到欺诈、胁迫才签订的协议，那么这份协议就可能会被认定为无效或者是可撤销的。在这种情况下，财产的归属可能需要重新确定。
撤销权的行使：根据法律规定，因重大误解订立的婚内财产协议，当事人自知道或者应当知道撤销事由之日起九十日内可行使撤销权；若协议订立后，一方发现协议显失公平并请求撤销的，需在知道或者应当知道撤销事由之日起一年内行使撤销权。撤销权的行使必须通过诉讼途径，并且要符合法律规定的条件和期限。
三、法定共同财产的情况
法定共同财产的定义：法律还规定了像工资、奖金等属于法定夫妻共同财产。这些财产在婚姻关系存续期间取得，无论是否以书面形式约定，都视为夫妻共同财产。
协议与法定规定的冲突：即便协议中有与法定共同财产规定相反的约定，在离婚的时候，这些财产仍有可能会作为共同财产来进行分割。这是因为法定共同财产的规定具有强制性，不能通过协议来完全排除。
四、实际操作中的建议
明确协议目的：在签订婚内财产协议前，双方应清晰确定目的，例如为明确婚后双方各自财产的归属，避免未来财产混淆产生争议。
确保双方自愿：协议的有效关键在于双方自愿。双方应在完全自愿、无任何外界干扰的情况下签订协议，不存在一方欺诈、胁迫另一方的情形。
细化协议内容：协议应详细罗列双方各类财产情况，包括不动产、动产、存款、债权等，并清晰约定财产归属、分割方式及处分权等。
完成签字盖章：双方应签字并注明日期，以确保协议的法律效力。
总结来看，婚内协议约定财产归女方所有，在协议有效且合法的情况下，这些财产在法律上被视为女方的个人财产，但仍属于婚内财产的范畴。然而，如果协议存在问题或与法定共同财产的规定相冲突，财产的归属可能需要重新确定。因此，在签订婚内财产协议时，双方应谨慎对待，确保协议内容合法、有效且明确。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。