被公司开除后，工资是否会被扣除需依据具体情形来判断。以下是从不同角度进行的分析：
员工存在故意或重大过失的情况：
- 若员工因故意或重大过失给公司造成经济损失，公司有权按照劳动合同的约定要求员工进行赔偿。这种赔偿可以从员工的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。同时，扣除后的剩余工资不得低于当地的月最低工资标准。例如，员工因违规操作导致公司设备损坏，公司可以按照规定扣除一定比例的工资用于赔偿损失。
公司无合法理由开除员工的情况：
- 若公司无合法理由开除员工，这属于违法解除劳动合同。在这种情况下，公司不仅不能扣除员工的工资，还应支付赔偿金。赔偿金的标准通常是经济补偿标准的二倍，而经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
员工严重违反公司规章制度等情况：
- 若员工严重违反公司规章制度等，公司有权依法解除劳动合同。在这种情况下，员工的工资应正常发放，公司不得无故克扣。
若员工与公司就工资扣除问题产生争议，可以采取以下措施：
- 协商解决：首先尝试与公司进行协商，明确指出公司的行为可能违反了劳动法，并要求公司支付应得的工资。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，并提交能证明劳动关系及未支付工资的证据，如劳动合同、考勤记录、工资条等。
- 申请劳动仲裁：若投诉后问题仍未得到解决，可以向劳动仲裁机构申请仲裁。在申请时，需要提交仲裁申请书及相关证据。
- 提起诉讼：若对仲裁结果不满意，可以在规定的时间内向法院提起诉讼。法院会根据事实和法律进行判决，并要求公司支付应得的工资及可能的赔偿金。
在整个过程中，员工要注意收集和保存相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录、与公司沟通的聊天记录或通话录音等，以便在需要时维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。