结论：父亲在有能力的情况下拒绝为患重大疾病的儿子支付医疗费，这一行为是不合法的，儿子及其法定代理人（如母亲）有权通过法律途径要求父亲承担相应的医疗费用。

法律背景与依据

根据《民法典》的相关规定，父母与子女间的关系不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。这包括在子女患病时，父母有义务提供必要的医疗费用。

具体来说，《民法典》第一千零八十五条规定：“离婚后，子女由一方直接抚养的，另一方应当负担部分或者全部抚养费。负担费用的多少和期限的长短，由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。前款规定的协议或者判决，不妨碍子女在必要时向父母任何一方提出超过协议或者判决原定数额的合理要求。” 在子女患重大疾病的情况下，医疗费用往往超出常规的抚养费用，因此子女或其法定代理人有权要求另一方父母承担额外的医疗费用。

法律建议

1. 协商解决：

   • 首先，可以尝试与父亲进行协商，说明儿子的病情和医疗费用的紧迫性，争取父亲自愿承担部分或全部医疗费用。

2. 法律途径：

   • 如果协商无果，儿子或其法定代理人可以向人民法院提起诉讼，要求父亲承担医疗费用。
   • 在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明儿子的病情、医疗费用的合理性以及父亲的经济能力。
   • 法院将根据实际情况判决父亲承担相应的医疗费用。

3. 申请司法救助：

   • 如果家庭经济困难，无法承担诉讼费用或医疗费用，可以向当地司法局申请司法救助。
   • 司法救助可能包括减免诉讼费用、提供法律援助等。

可能的法律后果

• 如果父亲被判决承担医疗费用而拒不履行，儿子或其法定代理人可以向人民法院申请强制执行。
• 法院有权采取多种强制执行措施，如查封、扣押、拍卖父亲的财产等，以确保医疗费用的支付。
• 此外，父亲的行为可能构成遗弃罪（如果情节严重），但这一罪名通常适用于长期不履行抚养义务的情况。在本案中，更可能的是通过民事诉讼途径解决。

实际案例参考

以小林案为例，小林出生于2013年，后随母亲生活，父亲每月支付抚养费。不幸的是，小林被诊断为儿童孤独症，需要巨额治疗费用。虽然父母约定双方共同支付小林的医疗、教育费用，但父亲一直以各种理由拒绝、拖延。最终，在检察院的支持起诉下，小林父亲支付了医疗费等费用。这一案例表明，在子女患重大疾病的情况下，父母有义务承担医疗费用，且法律会支持子女的合法权益。

总结：父亲在有能力的情况下拒绝为患重大疾病的儿子支付医疗费是不合法的。儿子或其法定代理人有权通过协商、法律途径或申请司法救助等方式要求父亲承担医疗费用。如果父亲拒不履行判决，还可能面临强制执行等法律后果。因此，建议尽快采取行动，维护儿子的合法权益。如果有任何法律问题，可以直接向我咨询。