针对您提出的“科室医生集体收药品回扣怎么处理”这一问题，这是一个涉及职业道德、法律法规以及医院管理等多个层面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、行为性质与法律后果
科室医生集体收药品回扣，不仅严重违反了医生的职业道德和行业规范，更可能触犯法律，构成商业贿赂甚至犯罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，这种行为可能涉及受贿罪或非国家工作人员受贿罪，具体取决于医生的身份和受贿数额。一旦查实，涉事医生将面临严厉的法律制裁，包括有期徒刑、罚金等。
二、内部处理与证据收集
- 立即调查：医院在接到举报或发现相关线索后，应迅速成立专项调查小组，对涉事科室进行全面深入的调查。
- 证据收集：调查过程中，必须确保收集到充分的证据，如财务记录、交易凭证、通讯记录、证人证言等，这些证据将为后续处理提供坚实依据。
- 纪律处分：根据调查结果，医院应依法依规对涉事医生进行严肃处理，包括警告、记过、降职、撤职、开除等纪律处分。
三、上报与通报
- 向管理部门报告：确认存在回扣行为后，医院应立即向卫生健康主管部门等上级管理部门报告，以便上级部门及时掌握情况并采取相应措施。
- 内部通报警示：医院还应在内部进行通报，警示其他医护人员，表明对违规行为的零容忍态度，从而营造风清气正的医疗环境。
四、法律追责与行政处罚
- 行政处罚：卫生健康主管部门可根据相关法律法规对涉事医院和医生给予行政处罚，如警告、罚款、吊销执业许可证等。
- 行业禁入：对于情节特别严重的医生，可将其列入行业禁入名单，禁止其在一定期限内或终身从事医疗卫生行业。
- 刑事责任追究：若医生集体收回扣的行为涉嫌犯罪，医院应依法移送司法机关追究刑事责任。
五、完善管理制度与预防机制
- 加强教育培训：医院应加强对医生的职业道德教育和法律法规培训，提高医生的廉洁意识和法律意识。
- 完善采购制度：建立健全药品、医疗器械采购管理制度，加强对采购过程的监督和审计，确保采购活动公开透明。
- 强化监督机制：建立健全监督机制，加强对医生处方、用药等行为的监管，及时发现并纠正违规行为。
- 公开透明与沟通：医院应保持公开透明，及时向社会公布处理结果，与患者和公众进行积极沟通，维护医疗机构的声誉和公信力。
六、其他相关责任方处理
- 医药企业处理：涉及给予医生回扣的医药企业也应受到相应处理，市场监督管理部门可依据相关法律法规对其进行查处。
- 民事赔偿责任：如果医生收回扣的行为给患者造成了损害，患者可通过民事诉讼的方式要求涉事医生、医院及相关医药企业承担民事赔偿责任。
综上所述，科室医生集体收药品回扣是一种严重的违法违规行为，需要医院、卫生健康主管部门以及司法机关等多方面共同努力来加以遏制。通过加强内部管理、完善制度、加强教育和监督以及依法追责等措施，我们可以有效预防类似事件的发生，维护医疗行业的廉洁性和公信力。