在处理实现担保物权特别程序案件时，关于诉讼费的收取，特别是申请费的计算，是一个需要细致了解的问题。以下是对此问题的详细解答：
首先，实现担保物权特别程序案件中的申请费，是依法减半收取的。这一点非常关键，因为它直接影响了您最终需要支付的金额。
接下来，申请费的收取标准是根据申请实现担保物权的财产数额来按比例计算的。具体来说：
如果财产数额不超过1000元，或者根本不涉及财产数额，那么每件案件只需交纳50元的申请费。
如果财产数额超过1000元但不超过10万元，那么超出1000元的部分需要按照1%的比例来交纳申请费。例如，如果财产数额是5万元，那么1000元部分交50元，剩下的49000元部分按1%交490元，总共就是540元。但由于是减半收取，所以实际只需交纳270元。
如果财产数额超过10万元，那么超出10万元的部分需要按照0.5%的比例来交纳申请费。不过，这项费用有一个上限，即5000元。这意味着，无论财产数额有多大，超出10万元部分的申请费最多只会收取5000元。
为了更直观地理解这个计算方式，我们可以再举一个例子：假设申请实现担保物权的财产数额是20万元。那么，1000元部分交50元，1000元到10万元的部分（即99000元）按1%交990元，剩下的10万元部分按0.5%交5000元（但因为上限是5000元，所以这里就是5000元）。总共是50+990+5000=6040元。但由于是减半收取，所以实际只需交纳3020元。
此外，还需要注意的是，担保物权诉讼费用并不仅仅包括申请费，还可能包括案件受理费等其他费用。这些费用的具体金额会根据诉讼请求的金额或价额来分段累计交纳。不过，在实现担保物权特别程序案件中，我们主要关注的是申请费的收取。
综上所述，实现担保物权特别程序案件中的申请费是依法减半收取的，其收取标准根据申请实现担保物权的财产数额按比例计算。在涉及此类案件时，您一定要清楚申请费的计算方式，以确保自身的权益和成本支出得到合理控制。