针对您提出的“非法经营发生安全事故如何处理”的问题，我将结合相关法律法规和实际案例，为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，非法经营行为本身就违反了市场管理法规，一旦发生安全事故，处理起来将更为复杂和严重。具体来说，处理流程可以分为以下几个步骤：

一、行政责任处理

当非法经营行为被市场监管等部门发现后，首先会面临行政责任的处理。根据相关法律法规，市场监管部门有权责令非法经营者停止经营，没收其违法所得，并处以相应的罚款。这一步骤的目的是纠正非法经营行为，防止其继续危害市场秩序和消费者权益。

二、民事责任赔偿

如果非法经营过程中发生的安全事故导致了他人人身或财产的受损，那么非法经营者还需要承担民事责任，即进行侵权赔偿。赔偿范围通常包括医疗费、误工费、财产损失等费用。这一步骤的目的是保障受害者的合法权益，使其能够得到应有的经济补偿。

三、刑事责任追究

如果非法经营行为及其导致的事故后果严重到构成刑事犯罪，那么非法经营者还将面临刑事责任的追究。根据犯罪情节和危害后果的不同，可能涉及的罪名包括非法经营罪、重大责任事故罪等。司法机关将依据相关法律法规，对非法经营者进行定罪量刑。

四、配合调查与主动赔偿

在处理非法经营安全事故的过程中，非法经营者应当积极配合相关部门的调查工作，如实提供相关信息和证据。同时，如果条件允许，非法经营者还应当主动赔偿受害者的损失，以争取从轻处理。这一步骤的目的是体现非法经营者的悔过态度，减轻其法律责任。

实际案例分析

以小朱为例，他未取得相关经营许可，擅自开展某类经营活动，并在经营过程中发生事故，导致小丽人身受伤和部分财物损坏。市场监管部门介入调查后，对小朱的非法经营行为给予了责令停止经营、没收违法所得、罚款等行政处罚。同时，小丽也要求小朱赔偿自己的损失。由于事故后果严重，司法机关还对小朱是否构成犯罪展开了调查。如果小朱能够积极配合调查，主动赔偿小丽的损失，那么他有可能争取到从轻处理的机会。

综上所述，非法经营发生安全事故后，非法经营者将面临行政责任、民事责任和刑事责任的追究。因此，我建议您在从事经营活动时，务必遵守相关法律法规，取得必要的经营许可，以确保经营活动的合法性和安全性。如果遇到类似问题，请及时咨询专业律师或相关部门的意见。