结论是：农村在自己菜地建20公分高的围墙是否违法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、土地性质与规划
若菜地属于宅基地范围：
- 一般来说，宅基地上的建筑活动需符合当地规划和建设要求。20公分高的围墙，若仅作为边界标识或简单防护，且未违反当地关于宅基地建筑高度、风格等具体规定，通常不会被认定为违法。
- 但需注意，即使高度较低，若围墙建设未经过相关部门审批或备案，也可能存在合规风险。
若菜地属于农用地（非宅基地）：
- 农用地上的建筑活动受到严格限制，通常不允许擅自改变土地用途或进行非农业建设。
- 即使围墙高度仅为20公分，若未经相关部门批准，擅自建设也可能构成违法，因为这可能违反了土地管理法中关于农用地保护的规定。
二、当地政策与规定
- 不同地区对于农村建筑活动的管理政策可能存在差异。有些地区可能对围墙的高度、材质、建设位置等有具体规定。
- 因此，在建设围墙前，建议先了解当地的相关政策和规定，确保建设活动符合要求。
三、相邻关系与权益
- 在建设围墙时，还需考虑相邻关系。若围墙建设影响了邻居的通风、采光、排水等权益，可能引发纠纷。
- 即使围墙高度较低，若对邻居造成了实质性影响，也可能面临法律责任。
四、法律建议
- 提前咨询：在建设围墙前，建议先向当地土地管理部门或规划部门咨询相关政策和规定，确保建设活动合法合规。
- 办理审批手续：若需要建设围墙，应按照当地要求办理相关审批手续，如申请建设许可证等。
- 尊重相邻权益：在建设围墙时，应尊重邻居的合法权益，避免对邻居造成实质性影响。
若您在农村菜地建设围墙方面存在疑问或遇到法律问题，可以直接向我咨询。我会结合您的具体情况，为您提供专业的法律建议。