结论：企业因员工饮酒后上班而阻止其回家，并算作一天旷工扣除三个月综合奖的做法，一般是不合法的，但具体还需结合企业规章制度、劳动合同以及实际情况来判断。
从企业规章制度的角度分析
规章制度需合法且合理：
- 企业的规章制度必须符合国家法律法规的规定，且内容合理，不得侵犯员工的合法权益。如果企业的规章制度中明确规定了“饮酒后上班视为旷工并扣除相应奖金”，那么该条款本身可能因违反法律法规或公序良俗而无效。
- 即便规章制度中有此类规定，也需要考虑其合理性。例如，是否对所有员工一视同仁，是否给予了员工申诉或解释的机会等。
规章制度需经过民主程序：
- 企业的规章制度必须经过民主程序制定，即应当与工会或者职工代表平等协商确定，并公示或者告知劳动者。如果规章制度未经民主程序制定，或者未公示、告知劳动者，那么该规章制度对劳动者不具有约束力。
从劳动合同的角度分析
劳动合同的约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了“饮酒后上班视为旷工并扣除相应奖金”，那么该约定可能因违反法律法规或公序良俗而无效。
- 即便劳动合同中有此类约定，也需要考虑其是否显失公平。例如，扣除三个月综合奖是否过于严厉，是否超出了合理范围等。
劳动合同的变更：
- 如果企业想要变更劳动合同中的相关条款，如增加“饮酒后上班视为旷工并扣除相应奖金”的条款，必须与劳动者协商一致，并采用书面形式。未经劳动者同意，企业不得单方面变更劳动合同。
从实际情况的角度分析
员工的行为是否构成旷工：
- 旷工通常指的是员工无正当理由未到岗工作。在本案例中，员工因饮酒后上班被企业阻止回家，是否构成旷工需要具体分析。如果员工确实因饮酒而无法正常工作，且企业已经给予了合理的安排（如安排休息、调岗等），但员工拒绝接受，那么可能构成旷工。但如果企业直接阻止员工回家并算作旷工，可能缺乏合理性。
扣除奖金的合理性：
- 即便员工的行为构成旷工，企业扣除其三个月综合奖的做法也可能缺乏合理性。奖金通常是对员工工作表现的奖励，与旷工行为无直接关联。企业可以依据规章制度对员工进行处罚，但处罚应当与违规行为相适应，不得过度处罚。
建议与后果
建议：
- 员工可以与企业进行沟通协商，要求企业撤销不合理的处罚决定。
- 如果沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果企业的做法被认定为违法或不合理，可能需要承担相应的法律责任，如支付员工被扣除的奖金、赔偿员工因此遭受的损失等。
总结：企业因员工饮酒后上班而阻止其回家并算作一天旷工扣除三个月综合奖的做法，一般是不合法的。员工可以与企业进行沟通协商，或者向当地劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。