当股东权益被非法侵占时，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
证据收集：
- 首要任务是收集并保存所有能证明股东权益被侵占的相关资料。这些资料可能包括但不限于财务报表、交易记录、会议记录、往来邮件等。这些证据将作为后续维权行动的重要支撑，确保您能够有力地证明权益被侵占的事实。
内部沟通与协商：
- 在收集到足够证据后，您可以尝试与其他股东或公司管理层进行沟通，明确指出侵占行为，并要求其停止侵权并归还被侵占的权益。内部沟通往往能更直接、更快速地解决问题，避免不必要的法律纠纷。
发函告知：
- 如果内部沟通无果，您可以考虑向侵占方发送一封正式的函件。在函件中，您应清楚地表明对方行为的违法性，并明确要求其改正。同时，务必保存好发函的记录，以备后续需要。
公司内部监督与申诉：
- 您还可以向公司内部的监督机构，如监事会或董事会提出申诉，要求其采取措施维护股东权益。这些机构作为公司的监督机构，有责任对侵占行为进行调查和监督，并要求侵占方返还利益。
法律途径：
- 如果上述措施均未能有效解决问题，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。具体来说，您可以向法院提起诉讼，要求侵占方承担侵权责任，赔偿损失，并恢复您的股东合法权益。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来支持自己的主张。
在采取上述措施时，您还需要注意以下几点：
- 保持冷静与理性：面对权益被侵占的情况，保持冷静和理性至关重要。避免采取过激行为，以免给自己带来不必要的麻烦。
- 及时咨询专业律师：虽然我可以为您提供一定的法律建议，但在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，及时咨询专业律师，根据您的具体情况制定合适的维权策略，是非常必要的。
- 加强公司监督：为了防止类似情况再次发生，您还应加强对公司的监督。这包括参加股东大会、行使股东权利、关注公司财务状况等。通过加强监督，您可以更好地保护自己的股东权益。
最后，我想强调的是，股东权益的保护是一个复杂而细致的过程。在面对权益被侵占的情况时，您需要综合运用多种手段来维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。