遇到土地纠纷时，如果对方不愿意来村里进行调解，这确实是一个需要妥善处理的问题。以下是一些详细的建议，希望能帮助您有效应对这种情况：

一、尝试再次沟通

首先，您可以尝试与对方进行再次沟通，了解他们不愿意来调解的具体原因。有时候，对方可能只是对调解过程或结果有所顾虑，通过诚恳的交流，您可能能够消除他们的疑虑，并说服他们参与调解。

二、寻求第三方协助

如果自行沟通无果，您可以考虑寻求第三方的协助。这包括：

1. 当地基层组织：如村民委员会、乡镇人民政府等。这些组织对当地情况熟悉，有一定的调解经验和能力，他们可以出面协调，促使双方达成和解。
2. 农村土地承包仲裁机构：如果纠纷属于土地承包经营纠纷等特定类型，您可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁。仲裁具有专业性和高效性，能够快速解决纠纷。

三、准备法律途径

如果调解和仲裁都无法解决问题，那么您可能需要考虑通过法律途径来解决纠纷。具体步骤如下：

1. 收集证据：在提起诉讼之前，您需要收集并固定与土地权属、纠纷相关的证据。这些证据可能包括土地承包合同、土地证、证人证言、土地使用现状的相关照片等。证据的充分性和合法性对于诉讼的成败至关重要。
2. 提起诉讼：准备好相关证据后，您可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院会依据事实和法律作出公正判决。

四、遵守法律程序

在整个处理过程中，您需要严格遵守法律程序，理性对待纠纷。避免采取过激行为，如私自改变土地现状、破坏对方财物等，这些行为可能给您带来不必要的法律风险。

五、考虑行政处理

如果纠纷涉及土地权属争议，您还可以考虑申请人民政府处理。政府会进行调查和处理，并作出行政决定。如果您对行政决定不服，还可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

六、保留相关证据

无论采取哪种解决途径，您都需要注意保留相关证据。这些证据在后续处理中可能起到关键作用，有助于您维护自己的合法权益。

总之，遇到土地纠纷对方不愿意来村里调解的情况时，您可以通过再次沟通、寻求第三方协助、准备法律途径、遵守法律程序、考虑行政处理以及保留相关证据等方式来应对。希望这些建议能够帮助您有效解决问题。