总包公司在分包公司欠薪且未签订委托代发协议的情况下，能否代发工资需分情况讨论：

1. 若欠薪对象为农民工

• 总包公司负有代付义务。根据《保障农民工工资支付条例》第三十条，分包单位拖欠农民工工资的，由施工总承包单位先行清偿，再依法追偿。这一规定旨在保障农民工基本权益，确保工资及时发放。
• 例外情形：若建设单位或总包公司将工程发包给不具备合法经营资格的单位或个人，导致拖欠工资的，由建设单位或总包公司清偿。
• 法律后果：总包公司未履行代付义务的，可能面临行政处罚（如罚款）或农民工通过法律途径主张权利。

2. 若欠薪对象为非农民工（如普通员工）

• 法律无强制代付义务。对于分包公司拖欠普通员工工资的情况，法律未规定总包公司必须代付。
• 合同约定优先：若总包公司与分包公司签订的合同中明确约定了代付条款（如“分包公司欠薪时，总包公司有权代付并追偿”），则总包公司需按合同履行；若无约定，总包公司可自行决定是否代付。
• 代付后的追偿权：若总包公司选择代付，可依据《民法典》第五百二十四条（第三人代为履行）或合同约定，向分包公司追偿代付的工资。

3. 实务建议

• 总包公司：
  1. 审查与分包公司的合同，明确代付条款及追偿机制。
  2. 若分包公司欠薪，优先核实欠薪对象身份（农民工或普通员工），再决定是否代付。
  3. 代付后及时留存证据（如付款凭证、欠薪证明），以便追偿。
• 分包公司员工：
  1. 若为农民工，可直接要求总包公司支付工资，并保留欠薪证据（如工资条、考勤记录）。
  2. 若为普通员工，可先向分包公司主张权利，无果后再考虑是否通过总包公司（如有合同约定）或法律途径解决。

总结：总包公司能否代发分包公司欠薪，关键在于欠薪对象是否为农民工以及合同是否有约定。若涉及农民工工资，总包公司必须代付；若为其他员工，则需依据合同或自行决定。如有进一步疑问，可直接向我咨询劳动纠纷相关问题。