当自治条例与法律、行政法规发生冲突时，我们可以依据《中华人民共和国立法法》的相关规定来处理这类问题。以下是对此问题的详细解答：

首先，我们要明确的是，不同效力等级的法律规范之间如果发生冲突，下一等级的法律规范是自然无效的，这并不需要有权机关作出明确的宣布。例如，如果自治条例与上位法（如法律、行政法规）相冲突，那么自治条例中与上位法相抵触的部分是无效的。

其次，对于同一机关制定的法律、行政法规、地方性法规、自治条例和单行条例、规章，如果它们之间属于特别法与一般法、特别规定与一般规定、特别条款与一般条款的关系，并且两者之间规定不一致，那么我们应该适用特别法、特别规定、特别条款的规定。这是因为特别法往往针对特定情况或特定领域作出更为详细和具体的规定。

再者，如果法律之间、行政法规之间对同一事项的新的一般规定与旧的特别规定不一致，且不能确定如何适用时，我们需要根据制定机关的不同来分别处理。具体来说，法律之间的这种冲突由全国人大常委会裁决；行政法规之间的这种冲突则由国务院裁决。

此外，对于不同机关制定的效力相同的法律规范之间的规定不一致的情况，也有相应的解决机制。例如，地方性法规与部门规章之间对同一事项的规定不一致，且不能确定如何适用时，由国务院提出意见。如果国务院认为应当适用地方性法规，那么就应当决定在该地方适用地方性法规的规定。

最后，特别需要注意的是，根据授权制定的法规与法律不一致，且不能确定如何适用时，由全国人大常委会裁决。这是为了确保法律的统一性和权威性。

综上所述，当自治条例与法律、行政法规发生冲突时，我们应该根据《中华人民共和国立法法》的相关规定来处理，确保法律的适用既符合法律规定，又能够维护社会的公平和正义。希望这个解答能够帮助您更好地理解这个问题。