补充合同跨年了，收入是否确认在当期，需根据具体情况及会计准则来判断。以下是从不同角度进行的分析：

1. 会计准则的角度：

   • 根据一般的会计准则，收入的确认应当遵循权责发生制原则，即收入应当在产生权利和责任时确认，而不是在收到或支付现金时确认。因此，如果补充合同的内容涉及当期（即合同签订或生效的会计期间）的收入或费用，且满足收入确认的条件（如商品或服务的交付、风险的转移等），那么这部分收入或费用应当确认在当期。
   • 如果补充合同涉及的是对之前已确认收入的调整（如折扣、退货等），且这种调整影响了当期的收入金额，那么也需要在当期进行相应的会计处理。

2. 合同条款的角度：

   • 补充合同的具体条款对收入确认的时间点有直接影响。如果补充合同明确规定了收入确认的时间点（如“本补充合同生效后，甲方应于XX日内支付乙方XX元，该款项作为当期收入确认”），则应按照合同条款执行。
   • 如果补充合同未明确规定收入确认的时间点，则需要根据合同的整体内容、交易习惯以及会计准则来判断。

3. 税务处理的角度：

   • 税务处理上，收入的确认时间可能影响税款的计算和缴纳。因此，在确认收入时，还需要考虑税务法规的要求。例如，某些税务法规可能规定，收入应在收到款项时确认，或者在某些特定条件下（如预收款、分期收款等）有特殊的确认规则。
   • 如果补充合同涉及跨年度的收入确认，还需要注意税务年度截止日期的规定，以确保税款的准确计算和及时缴纳。

法律建议：

• 在处理补充合同跨年度的收入确认问题时，建议首先仔细审查补充合同的具体条款，明确收入确认的时间点和条件。
• 同时，结合会计准则和税务法规的要求，进行综合判断。如果存在不确定或争议的情况，建议咨询专业的会计师或税务师，以确保会计处理的准确性和合规性。
• 如果因收入确认问题引发合同纠纷，应及时寻求法律援助，通过法律途径解决争议。

可能的法律后果：

• 如果收入确认不当，可能导致会计报表的失真，进而影响企业的财务状况和经营成果的反映。
• 在税务方面，如果收入确认时间不符合税务法规的要求，可能面临税款调整、罚款等法律后果。
• 如果因收入确认问题引发合同纠纷，且未能通过协商或调解解决，可能面临诉讼或仲裁等法律程序。

因此，在处理补充合同跨年度的收入确认问题时，应谨慎对待，确保符合会计准则、税务法规以及合同条款的要求。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。