合同诈骗五千元，在全国大多数地区一般不可以立案为刑事案件。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、全国性立案标准

根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》第七十七条的规定，以非法占有为目的，在签订、履行合同过程中骗取对方当事人财物，数额达到二万元以上的，才应予立案追诉。这意味着，从全国性的法律标准来看，五千元的合同诈骗金额一般未达到刑事立案的门槛。

二、地区性立案标准差异

尽管全国性规定设定了二万元的立案标准，但我国不同地区可能会根据实际情况，在上述全国性规定的框架内，调整并确定本地区执行的具体数额标准。因此，在某些经济较为发达或特别规定的地区，五千元的合同诈骗行为也有可能被视为达到或接近刑事立案的标准。然而，这种情况并不普遍，且需要具体查阅当地的相关规定。

三、未达到刑事立案标准的处理方式

对于未达到刑事立案标准的合同诈骗行为，受害人并非束手无策。他们完全可以通过民事诉讼的途径来维护自身的合法权益。具体来说，受害人可以向人民法院提起民事诉讼，要求诈骗方承担民事赔偿责任，包括返还被骗取的财物、赔偿因此产生的损失等。

四、法律建议

1. 及时咨询当地律师或法律机构：在遭遇合同诈骗时，建议受害人及时咨询当地的律师或法律机构，了解所在地区的具体立案标准，并根据实际情况采取相应的法律措施来维护自己的合法权益。
2. 保留证据：无论是否达到刑事立案标准，受害人都应尽可能保留与合同诈骗相关的证据，如合同文本、转账记录、聊天记录等，以便在后续的法律程序中证明自己的权益。
3. 谨慎签订合同：在签订合同时，应仔细阅读合同条款，确保合同内容合法、合规，并尽量避免与不熟悉或信誉不佳的对方签订合同。

综上所述，合同诈骗五千元在全国大多数地区一般不可以立案为刑事案件，但受害人仍可通过民事诉讼来寻求法律救济。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。