针对您提出的“应缴少缴税款案件应被罚款吗”这一问题，我将结合相关法律法规，为您详细解答。
首先，需要明确的是，应缴少缴税款案件是否会被罚款，并非一概而论，而是需要根据少缴税款的具体原因、情形及后果来综合判断。
一、因税务机关责任导致少缴税款
若因税务机关的责任，如未及时传达税收政策变更信息等，导致纳税人、扣缴义务人未缴或少缴税款，根据《中华人民共和国税收征收管理法》第五十二条的规定，税务机关在三年内可以要求补缴税款，但不得加收滞纳金，且在此情况下，纳税人、扣缴义务人通常不会被罚款。
二、因纳税人、扣缴义务人计算错误等失误导致少缴税款
若因纳税人、扣缴义务人自身的计算错误等失误导致未缴或少缴税款，税务机关在三年内可以追征税款及滞纳金。在特殊情况下，如累计数额超过10万元，追征期可延长至五年。但在此情形下，纳税人、扣缴义务人通常不会被罚款，只需及时补缴税款及滞纳金即可。
三、纳税人故意少缴税款（偷税行为）
若纳税人采取伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或在帐簿上多列支出、不列或少列收入，或经税务机关通知申报而拒不申报，或进行虚假的纳税申报等手段不缴或少缴应纳税款，则构成偷税行为。对于偷税行为，税务机关将依法进行严厉处罚：
行政处罚：税务机关将追缴其不缴或少缴的税款、滞纳金，并处以不缴或少缴税款百分之五十以上五倍以下的罚款。
刑事处罚：若偷税行为构成犯罪，还将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》第二百零一条的规定，逃避缴纳税款数额较大且占应纳税额百分之十以上的，可处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大且占应纳税额百分之三十以上的，可处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
四、其他情况导致少缴税款
如扣缴义务人应扣未扣、应收而不收税款，税务机关将向纳税人追缴税款，并对扣缴义务人处以应扣未扣、应收未收税款百分之五十以上三倍以下的罚款。此处的“罚款”属于行政处罚范畴，与刑事处罚中的“罚金”有所不同。
总结与建议：
应缴少缴税款案件是否会被罚款，取决于少缴税款的具体原因和情节。为避免不必要的法律风险和经济损失，我建议您严格遵守税法规定，如实申报纳税。同时，加强企业内部财务管理，确保税收政策的准确理解和应用。若遇到疑问或不确定的情况，及时咨询专业的税务机构或律师，以获取准确的法律指导和建议。