非法集资员工自己投资的处理方式，主要取决于员工在非法集资活动中的知情情况和所扮演的角色。以下是对此问题的详细分析：
一. 员工不知情的情况
- 视为受害者：如果员工在非法集资活动中并不知情，仅是基于对公司的信任或其他合理理由进行了投资，那么其投资行为应被视为受害者的损失。在这种情况下，员工有权向相关执法机构报案，并提供证据以证明自己的投资行为和资金损失，以便争取损失赔偿。
- 法律依据：虽然直接针对此情况的法律条文可能不具体，但根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，对被害人的合法财产，应当及时返还。这意味着，如果员工能够证明自己是非法集资的受害者，其合法财产应得到保护并返还。
二. 员工知情并参与的情况
- 视为违法所得：如果员工明知公司在进行非法集资活动，仍然积极参与并投入资金，那么其投资行为将可能被视为违法所得。根据《中华人民共和国刑法》第一百七十六条的规定，非法吸收公众存款或者变相吸收公众存款，扰乱金融秩序的，会受到相应的刑事处罚，并且违法所得及其收益会被追缴。在这种情况下，员工自己投入的资金也将被视为违法所得的一部分，可能会被依法追缴。
- 共同犯罪：如果员工在非法集资活动中起到了关键的作用，比如积极推广、诱导他人投资等，那么其可能会被视为共犯，承担更严重的法律责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，共犯也需要对自己的行为承担相应的法律责任。
- 退赃退赔的影响：如果员工在提起公诉前能够积极退赃退赔，减少损害结果的发生，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可以从轻或者减轻处罚。
三. 员工近亲属投资的处理
- 从个人吸收金额中扣除：在非法吸收公众存款罪案件中，对于相关业务人员的犯罪金额，都是以其实际参与吸收的金额来认定。因此，员工自己和近亲属投资的金额，可以从其个人吸收资金的金额中扣除。但需要注意的是，这类金额仍然要计入上一级业务员及单位的犯罪金额中。
我的观点：对于非法集资员工自己投资的处理，关键在于员工是否知情以及其在非法集资活动中的角色。员工应积极配合相关机关的调查，如实陈述自己的情况，并提供相关证据。同时，员工也应增强风险防范意识，避免参与任何非法集资活动。如有进一步需要，您可以继续咨询我。