法院在股东资格确认纠纷中，一般不会直接判令公司公章、财务章返还给大股东。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、股东资格确认纠纷的本质

股东资格确认纠纷主要解决的是股东身份的问题，即确认某人是否为公司的合法股东，以及其持股比例等。这类纠纷的核心在于股东身份的认定，而非公司财产或管理权的分配。因此，法院在处理此类纠纷时，通常会围绕股东身份的确认进行审理，并作出相应的判决。

二、公章、财务章的性质与归属

公章、财务章是公司的重要财产，属于公司所有，而非股东个人所有。这些印章的使用和管理通常受到公司章程、内部管理制度以及相关法律法规的约束。即使在大股东持有较多股份的情况下，也不能直接要求公司返还公章、财务章。因为印章的归属和使用权属于公司，而非个别股东。

三、法院判决的局限性

在股东资格确认纠纷中，法院的判决通常限于确认股东身份和持股比例等。对于公司财产或管理权的分配，如公章、财务章的返还问题，法院一般不会直接作出判决。这是因为这些问题涉及到公司的内部管理和运营，需要由公司自行决定或通过其他法律程序解决。

四、可能的法律途径与建议

1. 通过公司内部程序解决：如果大股东认为公司管理层或相关人员不当持有公章、财务章，可以尝试通过公司内部程序，如股东会决议、董事会决议等，要求返还印章。

2. 提起侵权之诉：如果大股东认为公司管理层或相关人员的行为构成侵权，如滥用职权、挪用资金等，可以提起侵权之诉，要求赔偿损失并返还印章。但需要注意的是，这种诉讼需要证明侵权行为的存在以及侵权行为与损失之间的因果关系。

3. 申请法院采取保全措施：在特定情况下，如大股东担心印章被滥用导致公司利益受损，可以向法院申请采取保全措施，如查封、扣押印章等。但这种措施需要满足一定的条件，并由法院根据具体情况进行决定。

建议：在处理此类问题时，大股东应首先通过公司内部程序或协商方式解决。如果无法达成一致，再考虑通过法律途径解决。同时，大股东在行使股东权利时，应遵守公司章程和相关法律法规的规定，不得损害公司和其他股东的利益。如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。