单位纪检部门要求员工自证清白时，员工应积极配合并提供充分证据以证明自身清白。以下是从法律角度给出的具体建议：

一. 明确指控或质疑的内容

• 分析指控的合理性：员工首先需要了解并明确纪检部门的具体指控或质疑内容，以便有针对性地收集证据进行反驳。

二. 收集并提供证据

1. 工作记录：员工可以提供自己的工作记录，包括工作任务、完成情况、汇报对象等，以证明自己在相关时间段内的行为和表现与违法行为无关。
2. 通信记录：如果可能的话，员工可以提供与涉嫌违法行为无关的通信记录，如与同事、上级或客户的正常沟通记录，以证明自己没有参与相关违法活动的讨论或策划。
3. 证人证言：员工可以寻求同事、上级或其他相关人员的证言，证明自己在相关时间段内的行为和表现与违法行为无关。
4. 其他证据：根据具体情况，员工还可以提供录像录音、物证等其他形式的证据来支持自己的主张。

三. 配合调查和主动说明情况

• 积极配合调查：在面临调查时，员工应当积极配合纪检部门的工作，并主动说明自己的情况。如果员工确实不知情或未参与违法行为，应当如实陈述，并提供相关证据来支持自己的主张。

四. 了解并引用相关法律法规

• 引用法律条款：员工在自证清白的过程中，可以了解并引用相关法律法规来支持自己的主张。例如，可以引用《中华人民共和国刑法》中关于非法集资等违法行为的规定，来说明自己的行为与这些规定不符。

五. 寻求专业法律帮助

• 聘请律师：如果员工感到自身难以应对法律程序或需要更专业的法律帮助，可以聘请律师来代理诉讼或提供法律咨询。律师能够为员工提供更专业的法律建议和辩护策略。

我的观点：在面对单位纪检部门的质疑时，员工应保持冷静和理智，积极配合调查并提供充分证据以证明自身清白。同时，员工也有权依法行使辩护权，维护自身的合法权益。如有必要，可以寻求专业律师的帮助来更好地应对法律程序。