在串通投标罪中，违法所得的认定应基于投标人通过串通投标行为所获得的非法利益，而直接经济损失的认定则涉及因串通投标行为给招标人或其他投标人造成的实际损失。

一. 违法所得的认定

1. 定义与范围：违法所得是指投标人通过串通投标这一违法行为所获得的利益。这通常包括因串通行为而中标后获得的合同金额与正常投标可能获得的合同金额之间的差额，以及因串通行为而获得的其他不正当利益。
2. 计算方式：在计算违法所得时，应扣除投标人因实施串通投标行为所投入的成本，如贿赂费用、串通费用等，以净收益作为违法所得的数额。若投标人通过串通投标获得了多个项目或合同，应将各项目的违法所得累计计算。

二. 直接经济损失的认定

1. 定义与范围：直接经济损失是指因串通投标行为直接导致的招标人或其他投标人的财产损失。这包括因串通行为而未能中标的投标人失去的商业机会、招标人因支付高价而多支出的费用等。
2. 计算方式：直接经济损失的计算应基于实际发生的损失，包括招标人因串通行为而多支付的费用、未中标投标人因失去商业机会而减少的收入等。在计算时，应确保损失与串通投标行为之间存在直接的因果关系，并排除其他可能导致损失的因素。

我建议，在认定串通投标罪中的违法所得和直接经济损失时，应充分考虑案件的具体情况和证据，确保认定的准确性和公正性。同时，对于违法所得和直接经济损失的数额，应依法进行审计和评估，以确保其真实性和合理性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。