针对您提出的“公司解除自然人与企业关系需要什么手续”的问题，这通常涉及到自然人与企业在税务、工商、社保等多个方面的关联解除。以下是我为您整理的详细解答：
一、税务方面
解除税务关联关系：
- 若自然人因离职需要与企业解除税务关联，需提供离职证明或其他可证明已离职的资料。
- 操作流程：在新电子税局中，展示自然人关联的纳税人信息，点击【解除关联】，选择解除原因为【离职后原任职单位未及时报告税务机关维护】，上传离职证明等资料，提交后等待税务机关审核。
- 若自然人身份被冒用登记，需提供公安机关报案回执或其他可证明被冒用的材料，按照类似流程操作。
税务登记注销（如企业整体注销）：
- 需提交《清税申报表》或《注销税务登记申请审批表》。
- 经办人身份证件。
- 根据具体情况，可能还需提交其他法律、行政法规规定的文件，如税务登记证件、吊销工商营业执照决定复印件等。
二、工商方面
企业登记注销（如企业整体注销）：
- 需提交《公司注销登记申请书》。
- 公司依照《公司法》作出解散的决议或者决定，人民法院的破产裁定、解散裁判文书，行政机关责令关闭或者公司被撤销的文件。
- 税务部门出具的企业清税文书。
- 股东会、股东大会、一人有限责任公司的股东、外商投资的公司董事会或者人民法院、公司批准机关备案、确认的清算报告。
- 对于申请简易注销登记的企业，还需提交《简易注销全体投资人承诺书》。
- 缴回营业执照正、副本（如企业领取了纸质版营业执照）。
仅解除自然人与企业工商关联（非企业整体注销）：
- 这种情况通常不涉及单独的工商注销手续，但可能需要更新企业股东或高管信息，具体需根据企业章程和工商部门要求办理。
三、社保方面
社保登记注销（如企业整体注销）：
- 需提交《社会保险登记证》原件（2016年10月1日后新办企业无需提供）。
- 根据单位的不同情况，还需分别携带登记证照注销或吊销、迁往外省市的文书复印件，有关部门批准解散、撤销、终止的文书复印件，或破产单位需携带人民法院正式宣告破产终结的文书复印件。
仅解除自然人与企业社保关联：
- 这种情况通常发生在自然人离职后，企业需在社保系统中更新该人员的就业状态，停止为其缴纳社保。具体操作需根据当地社保部门要求办理。
四、其他方面
- 海关注销（如涉及进出口业务的企业）：需提交注销申请书（含注销原因并加盖单位公章）。
- 外商投资企业商务提前解散：需提交行政许可事项申请书、行政许可事项授权委托书、受委托人身份证、关于经营期限届满前提前解散的股东会决议或董事会决议、外商投资企业批准证书正副本等。
总结
公司解除自然人与企业关系的手续因具体情况而异。若仅涉及自然人离职后的税务、社保关联解除，可按照税务和社保部门的要求提供相应资料并办理手续。若涉及企业整体注销，则需按照工商、税务、社保等部门的要求提交一系列注销材料。建议您在办理前详细咨询当地相关部门，以确保手续齐全、流程顺畅。