核心结论：在交通事故中对方全责且车辆报废但购置税发票丢失的情况下，您仍可通过其他证据材料主张车辆购置税损失，同时需按流程完成车辆报废及保险理赔手续。以下是具体分析：

一、购置税发票丢失不影响损失主张，但需补充证据

1. 法律依据
   根据《民法典》第1184条，侵害他人财产的，财产损失按照损失发生时的市场价格或其他合理方式计算。车辆购置税作为购车时的必要支出，属于直接财产损失，侵权方（对方）应当赔偿。

2. 证据替代方案
   若购置税发票丢失，可通过以下材料证明购置税金额：

   • 税务机关出具的《车辆购置税完税证明》（可携带身份证、行驶证到税务局补办或查询）；
     
   • 购车合同中明确记载的购置税金额条款；
     
   • 银行转账记录（显示向税务机关支付购置税的流水）；
     
   • 4S店或销售方提供的购置税缴纳凭证（如加盖公章的收据或说明）。

二、车辆报废处理流程及保险理赔要点

1. 报废流程

   • 联系交警部门出具《交通事故责任认定书》（确认对方全责）；
     
   • 联系保险公司定损，确定车辆残值及报废标准；
     
   • 将车辆交至有资质的报废回收企业，取得《报废汽车回收证明》；
     
   • 到车管所办理车辆注销登记，取得《机动车注销证明》。

2. 保险理赔材料
   除购置税证据外，还需准备：

   • 交通事故责任认定书；
     
   • 车辆行驶证、驾驶证、保险单；
     
   • 报废汽车回收证明及注销证明；
     
   • 车辆购置发票（若丢失，可提供购车合同或付款记录）。

三、对方全责下的赔偿主张路径

1. 保险优先赔偿
   若对方投保了交强险及商业三者险，由其保险公司在责任限额内赔偿车辆损失（含购置税）。若保险不足，由对方个人补足。

2. 诉讼准备
   若协商或保险理赔受阻，可向法院起诉，需提交：

   • 起诉状（明确赔偿项目及金额）；
     
   • 证据材料（责任认定书、购置税证明、报废证明等）；
     
   • 损失计算清单（含车辆残值、购置税、其他合理费用）。

四、风险提示

• 时效限制：人身损害赔偿诉讼时效为3年，财产损失同样适用，建议尽快处理；
  
• 证据固定：及时保存与事故、车辆购置相关的所有材料，避免二次丢失；
  
• 协商技巧：与对方或保险公司沟通时，可引用《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第12条，强化主张合理性。

建议行动步骤：

1. 立即联系税务局补办购置税完税证明；
   
2. 同步推进车辆报废及保险理赔流程；
   
3. 若对方或保险公司拒赔，委托律师发送律师函或直接起诉。
   

如有进一步细节需核实（如保险条款、地区差异等），可直接向我提问。