公司实控人与关联交易方损害股东权益，股东是可以直接诉讼侵权的。以下从不同角度为您详细分析：
法律依据
根据《公司法》的相关规定，公司的董事、高级管理人员（在实际控制人通过控制公司决策损害股东利益时，实际控制人可视为类似责任主体）违反法律、行政法规或者公司章程的规定，损害股东利益的，股东有权向人民法院提起诉讼。这一规定为股东在权益受损时提供了法律救济途径。
诉讼条件与准备
诉讼条件：
- 股东需证明实际控制人与关联交易方的行为确实损害了其股东权益。
- 股东需证明该损害行为违反了法律、行政法规或公司章程的规定。
诉讼准备：
- 民事诉讼状：准备好详细的民事诉讼状，明确诉讼请求、事实和理由。
- 证据材料：提交相关证据材料，包括但不限于证明原告诉权的证据、证明原被告之间存在民事法律关系的证据、证明原告所诉事实和理由存在的证据等。
- 身份证明：提供原被告的身份证明，如原告为个人的，需提供身份证复印件；原告为单位的，需提供营业执照复印件、法定代表人身份证明书原件。
- 授权委托书：如委托他人诉讼，需提交授权明确的授权委托书及受托人身份证复印件。
实际控制人的认定与责任
实际控制人的认定标准包括但不限于：
- 单独或者联合控制一个公司的股份、表决权超过该公司股东名册中持股数量最多的股东行使的表决权；
- 单独或者联合控制一个公司的股份、表决权达到或者超过百分之三十；
- 通过单独或者联合控制的表决权能够决定一个公司董事会半数以上成员当选的；
- 能够决定一个公司的财务和经营政策、并能据以从该公司的经营活动中获取利益的；
- 有关部门根据实质重于形式原则判断某一主体事实上能对公司的行为实施控制的其他情形。
实际控制人虽对公司有绝对的控制权，但也有应履行的职责和义务。其权利需在公司章程的范围内行使，对恶意损害股东利益的行为，应承担相应的法律责任。
诉讼流程与后续
- 起诉：股东向具有管辖权的人民法院起诉，并提交相关证据材料。
- 参与诉讼：按照人民法院的通知准时出席参与诉讼活动。
- 上诉：若不服一审判决或裁定，应在接到判决书后15天内或接到裁定书后10天内向原审人民法院或上一级人民法院提出上诉，并递交上诉状。
建议：在股东合法利益受损的情况下，只要满足起诉条件，人民法院肯定会立案。因此，股东在发现实际控制人与关联交易方损害其权益时，应积极收集证据，及时向法院起诉，以维护自身合法权益。如果您在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。