关于车行收取服务费及GPS费是否合法的问题，这主要取决于费用的性质、收取方式以及是否事先明确告知消费者。

首先，我们来看服务费。在购车或办理车贷的过程中，车行可能会提供一系列的服务，如协助办理贷款手续、车辆评估、过户等。对于这些服务，车行有权收取一定的服务费，但前提是必须在提供服务前明确告知消费者，并得到消费者的同意。如果车行在未明确告知或未经消费者同意的情况下收取服务费，那么这种行为就可能构成不合法。

接下来，我们讨论GPS费。GPS设备的安装通常与贷款车辆有关，一些金融机构或银行可能会要求贷款车辆安装GPS设备，以便监控车辆位置，降低贷款风险。然而，这并不意味着车行可以随意收取GPS费。如果银行或金融机构确实要求安装GPS设备，并且这笔费用是由消费者承担的，那么车行应该提供明确的收费依据和标准，并在购车或办理贷款前告知消费者。如果车行在未明确告知或未经消费者同意的情况下收取GPS费，或者虚构了银行或金融机构的要求来收取费用，那么这种行为就可能构成欺诈或不合法。

以您提供的案例为例，韦先生在购买二手宝马汽车并办理贷款时，被车行要求支付1000元的GPS费。然而，后来韦先生发现车辆并未安装GPS系统，且银行方面也表示并未要求安装GPS或收取相关费用。在这种情况下，车行收取GPS费的行为就可能构成不合法，因为它既未提供实际的服务（安装GPS），也未得到消费者的明确同意。

综上所述，车行收取服务费及GPS费是否合法，主要取决于费用的性质、收取方式以及是否事先明确告知消费者。作为消费者，在购车或办理贷款时，应该仔细阅读合同条款，了解各项费用的性质和标准，并在必要时要求车行提供明确的收费依据。如果发现车行存在不合法收费的行为，可以向相关部门投诉或寻求法律援助。