员工拿公司钱不还，可能面临的惩罚制度主要依据其行为性质和后果的严重程度来判定，具体如下：
民事责任：
- 如果员工拿走的公司钱款属于借款或因工作原因暂时保管，但事后未归还，这通常被视为民事纠纷。公司有权要求员工归还钱款，并可以通过法律途径（如起诉）来追讨。在这种情况下，员工可能需要承担返还钱款、支付利息（如果约定了）以及可能的诉讼费用等民事责任。
刑事责任：
- 如果员工利用职务上的便利，将公司财物非法占为己有，且数额较大，这可能构成职务侵占罪。根据《刑法》第二百七十一条的规定，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
- 对于国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员，以及国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员，如果实施了类似行为，将依照《刑法》第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚，即可能构成贪污罪，处罚更为严厉。
行政责任：
- 在某些情况下，如果员工的行为违反了公司的规章制度或内部管理规定，但尚未达到刑事犯罪的程度，公司可能会依据内部规定对员工进行行政处罚，如警告、罚款、降职、解雇等。
其他后果：
- 除了上述法律责任外，员工还可能面临声誉损害、职业前景受阻等非法律后果。这些后果虽然不直接涉及法律制裁，但可能对员工的个人生活和职业发展产生长远影响。
针对员工拿公司钱不还的行为，公司可以采取以下措施：
- 首先，尝试与员工进行沟通，了解其未归还钱款的原因，并尝试通过协商解决问题。
- 如果沟通无果，公司可以依据内部规章制度对员工进行行政处罚。
- 同时，公司应收集相关证据（如借款协议、转账记录、员工职务证明等），以备不时之需。
- 如果怀疑员工的行为构成犯罪，公司应及时向公安机关报案，并配合调查工作。
建议：作为员工，应严格遵守公司的规章制度和法律法规，不得利用职务之便侵占公司财物。如果遇到经济困难或需要借款的情况，应与公司进行坦诚沟通，并按照规定程序办理借款手续。如果有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。