针对您提出的“单位实施只能由单位构成的犯罪怎么处罚自然人”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

在单位犯罪中，当犯罪行为只能由单位构成时，对自然人的处罚主要遵循以下原则和方式：

一、双罚制

双罚制是单位犯罪中处罚自然人最常见的方式。它包含两个层面的处罚：

1. 对单位的处罚：

   • 单位作为犯罪主体，会被判处罚金。罚金是对单位经济上的制裁，旨在剥夺其因犯罪行为可能获得的非法利益，并对其经济能力造成一定影响。

2. 对自然人的处罚：

   • 在单位犯罪中，直接负责的主管人员和其他直接责任人员会被判处刑罚。
   • 直接负责的主管人员：通常是对单位犯罪起决策、指挥等重要作用的人员，如单位的法定代表人、主要负责人或实际控制人等。他们因对单位犯罪负有直接责任，而会被追究刑事责任。
   • 其他直接责任人员：是在单位犯罪中具体实施犯罪行为的人员，如执行单位决策、具体操作犯罪行为的人员。他们因直接参与犯罪活动，而同样会被追究刑事责任。
   • 刑罚种类可能包括有期徒刑、拘役等，具体根据犯罪的性质、情节和后果来判定。

二、单罚制

在某些特定情况下，单位犯罪可能只处罚自然人而不处罚单位，这被称为单罚制。这种情况相对较少，但并非不存在。它主要适用于以下情形：

• 单位本身的存在状况特殊，如即将解散、破产或已不具备承担刑事责任的能力等。
• 犯罪行为的特殊性质，使得对单位进行处罚无法达到刑罚的目的，或对单位处罚无实际意义。

在单罚制下，通常处罚的是直接负责的主管人员和其他直接责任人员。他们因对单位犯罪负有直接责任，而会被单独追究刑事责任。

三、处罚目的与意义

对单位犯罪中的自然人进行处罚，旨在通过对相关责任人的惩处，实现刑罚的目的，包括预防单位犯罪的发生、维护社会的经济秩序等。同时，这也是对单位犯罪行为的一种有力震慑，有助于维护社会的公平正义和法治秩序。

综上所述，当单位实施只能由单位构成的犯罪时，对自然人的处罚主要遵循双罚制或单罚制原则。具体采用哪种方式，需根据犯罪的性质、情节、后果以及单位的具体情况来综合判定。