质保金与工程款的诉讼时效起算时间并不相同。具体分析如下：

一. 工程款的诉讼时效起算

• 工程款的诉讼时效通常是从工程款应付而未付之日起计算。这是基于一般的诉讼时效原则，即权利人知道或应当知道其权利受到损害时开始计算。

二. 质保金诉讼时效的起算

1. 质保金性质特殊：质保金是发包人与承包人在建设工程承包合同中约定的，从应付的工程款中预留，用以保证承包人在缺陷责任期内对建设工程出现的缺陷进行维修的资金。它具有担保工程质量的功能，与工程款在性质上并不相同。
2. 起算时间规定：根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，质保金的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在工程质保金的情境中，这通常意味着质保期届满后，若发包人未按约定返还质保金，承包人即知其权利受损，此时诉讼时效开始起算。
3. 与工程款诉讼时效的区别：由于质保金与工程款性质不同，因此它们的诉讼时效起算时间也不同。工程款是基于工程量的完成而支付的，而质保金则是基于工程质量的保证而预留的。因此，不能简单地将质保金视为工程款的最后一部分，从而以工程款的支付时间来确定质保金的诉讼时效起算时间。

我建议在处理质保金与工程款诉讼时效起算的问题时，应仔细审查合同条款及法律规定，确保准确理解两者之间的区别和各自的诉讼时效起算时间。如有进一步需要，您可以继续咨询我。