进度款与质保金的诉讼时效是分别计算的。以下从不同角度为您详细分析：

一、诉讼时效的基本概念

诉讼时效是指民事权利受到侵害的权利人在法定的时效期间内不行使权利，当时效期间届满时，债务人获得诉讼时效抗辩权。在建设工程领域，进度款和质保金作为工程款的不同组成部分，其支付条件和支付时间均有所不同，因此，它们的诉讼时效计算也应分别进行。

二、进度款诉讼时效的计算

1. 支付条件与时间：进度款通常根据工程进度或合同约定的节点进行支付。当发包人未按照约定支付进度款时，承包人即享有要求支付进度款的权利。
2. 诉讼时效起算点：根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，进度款的诉讼时效通常从发包人应支付而未支付进度款之日起计算。
3. 诉讼时效期间：根据现行法律规定，一般诉讼时效期间为三年。因此，承包人应在知道或应当知道发包人未支付进度款之日起三年内提起诉讼或申请仲裁。

三、质保金诉讼时效的计算

1. 质保金的性质与支付条件：质保金是发包人为了确保工程质量而在工程款中预留的一部分资金。在质保期内，如果工程出现质量问题，发包人有权从质保金中扣除修复费用。质保期满后，发包人应退还剩余质保金。
2. 诉讼时效起算点：质保金的诉讼时效通常从质保期满且发包人未退还质保金之日起计算。因为在此之前，承包人可能还需要承担工程质量修复的责任，因此不能简单地以工程竣工验收合格之日作为诉讼时效的起算点。
3. 诉讼时效期间：同样根据现行法律规定，质保金的诉讼时效期间也为三年。承包人应在质保期满且发包人未退还质保金之日起三年内提起诉讼或申请仲裁。

四、特殊情况下的诉讼时效计算

1. 双方约定延长质保期：如果双方在合同中约定了延长质保期，那么质保金的诉讼时效起算点应相应顺延至延长后的质保期满之日。
2. 发包人承诺退还质保金但未履行：如果发包人在质保期满后承诺退还质保金但未实际履行，承包人可以自发包人承诺退还之日起计算诉讼时效。

五、法律建议

1. 及时主张权利：无论是进度款还是质保金，承包人都应在知道或应当知道权利受到侵害之日起及时主张权利，避免超过诉讼时效期间。
2. 保留证据：承包人应妥善保留与进度款和质保金支付相关的证据，如合同、支付凭证、验收报告等，以便在诉讼或仲裁中证明自己的权利。
3. 咨询专业律师：如果您在进度款或质保金的诉讼时效计算方面存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。