结论：双包（通常指工程总承包中的设计-采购-施工总承包，即EPC模式）后，甲方是否可以指定材料供应商，需根据合同约定、法律规定及项目具体情况综合判断，具体如下：

1. 合同约定优先

• 若合同明确约定甲方有权指定材料供应商：则甲方可依据合同行使该权利，但需注意以下限制：
  • 供应商资质要求：甲方指定的供应商需符合国家或行业规定的资质标准（如《建筑法》第26条对承包单位资质的要求），否则可能导致合同无效或工程质量问题。
  • 价格与质量责任：若甲方指定供应商导致材料价格过高或质量不达标，承包方（乙方）可依据《民法典》第577条要求甲方承担违约责任，或主张调整合同价款。
• 若合同未约定或约定模糊：甲方无权单方面指定供应商，需与乙方协商确定。

2. 法律规定限制

• 强制招标范围：根据《招标投标法》第3条，若项目属于必须招标的范围（如全部或部分使用国有资金投资的项目），甲方指定供应商可能涉嫌规避招标，导致合同无效。
• 公平竞争原则：甲方不得通过指定供应商排除或限制其他潜在供应商的公平竞争，否则可能违反《反垄断法》第17条。

3. 项目性质影响

• EPC总承包模式：通常乙方负责材料采购，甲方干预需以合同为依据。若甲方强行指定供应商，可能构成对乙方承包范围的干预，引发纠纷。
• 甲指分包模式：若合同明确允许甲方指定分包商（包括材料供应商），则需按合同执行，但乙方仍需对分包工程的质量、安全等承担连带责任（《建设工程质量管理条例》第27条）。

4. 实务建议

• 甲方：若需指定供应商，应在合同中明确约定权利范围、供应商资质标准及违约责任，避免后续纠纷。
• 乙方：若甲方指定供应商不符合合同或法律规定，可拒绝使用并要求更换，或通过法律途径主张权利。

总结：甲方能否指定材料供应商，核心在于合同约定与法律规定的双重约束。建议双方在合同中明确权利义务，并在履行过程中遵守公平、合法原则。如有具体争议，可进一步提供合同条款或项目背景，以便更精准分析。