公司擅自没收个人违规挂证的钱是违法的。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、法律角度
财产权保护：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，公民的合法财产受法律保护，禁止任何组织或者个人侵占、哄抢、破坏。公司擅自没收个人违规挂证的钱，实际上是对个人财产权的侵犯，因为这笔钱即使属于违规所得，其处置也应遵循法定程序，而非由公司单方面决定。
行政处罚与民事赔偿的区别：
- 违规挂证可能面临行政处罚，如罚款、吊销执业资格等，但这些处罚应由相关行政机关依法作出，而非由公司自行执行。公司无权对个人进行行政处罚，更无权没收其财产。
- 如果公司认为个人违规挂证给其造成了损失，可以通过民事诉讼途径要求赔偿，但这与擅自没收财产是两种不同的法律行为。
二、合同与劳动关系角度
劳动合同约定：
- 如果公司与个人之间存在劳动合同关系，且合同中明确规定了关于违规行为的处理条款，那么公司应按照合同约定进行处理。但即使如此，合同中的条款也应符合法律法规的规定，不得侵犯个人的合法权益。
- 擅自没收财产通常不属于劳动合同中约定的正常处理方式，除非合同中有特别约定且该约定不违反法律法规的强制性规定。
劳动关系中的权益保障：
- 在劳动关系中，个人享有劳动报酬权、休息休假权、社会保险和福利权等多项权益。公司擅自没收个人财产，显然侵犯了其财产权，也可能间接影响到其他权益的实现。
三、实际操作与建议
公司应遵守的法律程序：
- 如果公司认为个人违规挂证，应首先通过内部调查核实情况，然后依据公司规章制度或劳动合同约定进行处理。但处理方式应合法合规，不得侵犯个人的合法权益。
- 如果需要追究个人的法律责任，公司应向相关行政机关举报或提起民事诉讼，而非自行采取没收财产等措施。
个人的维权途径：
- 如果个人认为公司擅自没收其财产的行为违法，可以通过与公司协商、向劳动监察部门投诉、提起劳动争议仲裁或民事诉讼等途径维护自己的合法权益。
综上所述，公司擅自没收个人违规挂证的钱是违法的。公司应遵守法律法规的规定，通过合法途径处理违规行为；个人也应了解自己的权益，并在权益受到侵害时及时维权。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。