已经出质的股权，法院是有权进行查封冻结的。以下从不同角度为您详细分析：

法律依据与法院权力

根据相关法律规定，人民法院在执行案件过程中，有权对被执行人的财产采取查封、扣押、冻结等执行措施。股权作为一种财产性权利，即便已经被质押，也并不影响法院依法对其进行冻结。这是为了保障申请执行人的合法权益得以实现，确保执行程序的顺利进行。

冻结目的与执行程序

法院冻结已出质股权的目的，在于通过控制被执行人的财产，促使其履行生效法律文书确定的义务。在执行过程中，法院会严格依照法定程序进行操作，确保各方当事人的合法权益不受侵害。冻结行为本身并不改变股权的质押状态，也不影响质权人在质押范围内的优先受偿权。

质权人与其他债权人的利益协调

在后续执行程序中，对于已质押股权的处置，法院会遵循相关法律规定和程序，协调好质权人与其他债权人之间的利益关系。这包括但不限于：在拍卖或变卖股权时，确保质权人能够优先受偿；在分配执行款时，按照法定顺序和比例进行分配等。通过这些措施，法院旨在实现执行目的的同时，维护法律的公正与权威。

实际操作中的注意事项

1. 及时沟通：在执行过程中，如果涉及已出质股权的冻结，法院通常会与质权人进行沟通，了解质押情况，确保冻结行为不会损害质权人的合法权益。
2. 依法处置：在处置已质押股权时，法院会严格按照法定程序进行，包括评估、拍卖或变卖等环节，确保处置过程的公开、公平、公正。
3. 权益保障：如果冻结行为给质权人或其他债权人造成了损失，相关当事人可以通过法律途径寻求救济，如提出执行异议、申请国家赔偿等。

建议：如果您作为出质人或质权人，面临已出质股权被法院冻结的情况，建议您及时与法院沟通，了解冻结的具体原因和执行程序，同时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。