若在逾期减免方案还清后又被扣款，可按以下步骤处理：

1. 核实扣款原因

   • 系统错误或操作失误：联系扣款方（如银行、贷款机构等）的客服部门，要求其提供扣款的详细依据和原因。若确认是系统错误或操作失误导致的重复扣款，要求其立即退还多扣款项。
   • 合同或协议条款：仔细审查与贷款机构签订的逾期减免方案合同或协议，确认其中是否有关“还清后仍可能扣款”的条款。若存在此类条款且你未充分了解或同意，可主张该条款显失公平或存在欺诈，要求撤销或修改。
   • 未结清费用：确认是否还存在其他未结清的费用，如利息、滞纳金、手续费等。若存在，需与贷款机构协商如何支付这些费用，并要求其停止不必要的扣款。

2. 提出异议并要求退款

   • 书面异议：向扣款方提交书面异议，详细说明扣款情况、你的还款记录以及你认为扣款不当的理由。要求扣款方在规定时间内（如7个工作日内）给予答复并退还多扣款项。
   • 保留证据：在提出异议的过程中，务必保留好所有相关证据，如还款记录、扣款通知、合同或协议等。这些证据将有助于你维护自己的合法权益。

3. 寻求监管部门或第三方机构的帮助

   • 向监管部门投诉：若扣款方未在规定时间内给予答复或拒绝退还多扣款项，你可以向相关监管部门（如银保监会、地方金融监管局等）投诉。监管部门将介入调查，并可能对扣款方进行处罚。
   • 寻求第三方调解或仲裁：你还可以考虑寻求第三方调解机构或仲裁机构的帮助。这些机构可以提供中立的调解或仲裁服务，帮助你与扣款方达成和解或作出公正裁决。

4. 考虑法律途径

   • 起诉扣款方：若以上途径均无法解决问题，你可以考虑向法院起诉扣款方。在起诉前，你需要准备好充分的证据和法律依据，以证明扣款方的行为构成违约或侵权。
   • 申请财产保全：在起诉过程中，若担心扣款方转移财产导致判决无法执行，你可以向法院申请财产保全措施，冻结扣款方的相关资产。