被告人已退赔大部分赃款，就尚未退赔款项出具借条后，是否还需要判处退赔，需分情况讨论：
一、借条的法律效力与退赔责任的关系
借条作为债务确认的效力：
- 借条是双方就债务关系达成的书面确认，具有法律效力。若借条内容合法、真实，且双方意思表示一致，则借条可以作为债务存在的证据。
- 在被告人已退赔大部分赃款的情况下，就尚未退赔的款项出具借条，可以视为双方对剩余债务的确认和安排。
退赔责任的独立性：
- 退赔责任是基于被告人的违法行为（如诈骗、盗窃等）而产生的法律责任，其目的在于恢复被害人的财产权益。
- 借条的出具并不免除被告人的退赔责任，除非在借条中明确约定了退赔责任的免除或替代方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定。
二、是否需要判处退赔的具体分析
若借条未涉及退赔责任的免除：
- 在此情况下，被告人仍需承担退赔责任。借条仅作为双方对剩余债务的确认，不影响被告人因违法行为而应承担的退赔义务。
- 法院在判决时，会综合考虑被告人的退赔情况、借条的内容以及被害人的损失情况，作出相应的判决。
若借条中明确约定了退赔责任的免除或替代方式：
- 需审查该约定是否合法、有效。若约定违反法律法规的强制性规定（如以非法方式免除退赔责任），则该约定无效，被告人仍需承担退赔责任。
- 若约定合法、有效，且双方均同意以借条中的方式替代退赔责任，则法院在判决时可能会考虑该约定，但也会谨慎审查，以确保被害人的权益得到充分保障。
三、法律建议
对于被害人：
- 在接受被告人出具的借条时，应仔细审查借条内容，确保其中未涉及非法免除退赔责任的条款。
- 若对借条内容有疑问或担忧，建议咨询专业律师，以维护自身合法权益。
对于被告人：
- 出具借条并不意味着可以免除退赔责任。应认真对待退赔义务，积极与被害人协商退赔事宜。
- 若确实无法一次性退赔全部款项，可以与被害人协商分期退赔或提供其他担保方式，以减轻法律责任。
总结来说，被告人已退赔大部分赃款后，就尚未退赔款项出具借条，并不意味着可以免除退赔责任。是否需要判处退赔，需根据借条的具体内容、双方的意思表示以及法律法规的规定进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。