商品二次包装并更换合格证、商品标签的行为，可能涉及违反《中华人民共和国商标法》以及《中华人民共和国产品质量法》的相关规定。以下是对此问题的详细分析：
一、违反《中华人民共和国商标法》
法律规定：
- 根据《中华人民共和国商标法》第五十七条的规定，未经商标注册人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标相同的商标，或者在同一种商品上使用与其注册商标近似的商标，容易导致混淆的，均属侵犯注册商标专用权的行为。此外，该条还明确规定了“未经商标注册人同意，更换其注册商标并将该更换商标的商品又投入市场的”也属于侵犯注册商标专用权的行为。
行为分析：
- 如果商品原有的商标被更换或覆盖，且未经商标注册人的许可，那么这种行为就构成了对商标权的侵犯。特别是当更换后的商标与注册商标相同或近似，且容易导致消费者混淆时，侵权性质更为明显。
二、违反《中华人民共和国产品质量法》
法律规定：
- 根据《中华人民共和国产品质量法》的相关规定，产品或者其包装上的标识必须真实，并符合下列要求：…（五）使用不当，容易造成产品本身损坏或者可能危及人身、财产安全的产品，应当有警示标志或者中文警示说明；（六）限期使用的产品，应当在显著位置清晰地标明生产日期和安全使用期或者失效日期；（七）产品存在使用性能的瑕疵，生产者应当在产品或者包装上标明。同时，该法还规定，销售者不得伪造或者冒用认证标志等质量标志，不得伪造产品的产地，伪造或者冒用他人的厂名、厂址，不得在产品中掺杂、掺假，不得以假充真、以次充好，不得以不合格产品冒充合格产品。
行为分析：
- 更换合格证和商品标签可能涉及伪造或冒用质量标志、伪造产地、厂名、厂址等行为，如果更换后的标签信息不真实，如生产日期、安全使用期等关键信息被篡改或伪造，那么这种行为就违反了《中华人民共和国产品质量法》的相关规定。此外，如果更换标签的目的是为了以次充好或以不合格产品冒充合格产品，那么这种行为同样违法。
三、法律责任与后果
民事责任：
- 侵犯商标权或违反产品质量法的行为人可能需要承担停止侵权、赔偿损失等民事责任。
行政责任：
- 工商管理部门等行政机关可以对侵犯商标权或违反产品质量法的行为进行查处，给予罚款、没收违法所得等行政处罚。
刑事责任：
- 如果行为人的违法行为情节严重，如销售金额达到法定标准或造成严重后果，那么可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
建议：在进行商品二次包装并更换合格证、商品标签时，务必确保所有行为均符合相关法律法规的规定。如果有任何疑问或不确定的地方，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。