针对您提出的“二次非法占用农耕地怎么处罚依据”的问题，我将从行政责任、刑事责任以及其他相关法律责任三个方面，为您详细阐述非法占用农耕地的处罚依据。
一、行政责任
责令限期改正或治理： 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，对于非法占用农耕地的行为，县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令限期改正或者治理。这意味着，非法占用者必须在规定的时间内恢复土地原状或进行必要的治理。
罚款： 非法占用农耕地的单位或个人还可能面临罚款的处罚。罚款的具体数额通常与非法占用的耕地面积和造成的损害程度相关。例如，非法占用永久基本农田发展林果业或者挖塘养鱼的，可能面临每亩十万元以下的罚款。若逾期不改正，罚款力度可能会加大。
没收违法所得： 对于因非法占用农耕地而获得的违法所得，相关部门有权予以没收。这是对非法行为的一种经济制裁，旨在剥夺非法占用者的不当利益。
拆除建筑物和其他设施： 在农耕地上非法建设的建筑物和其他设施，如果符合土地利用总体规划的，可能会被没收；如果不符合土地利用总体规划，则必须限期拆除并恢复耕种条件。这是对非法建设行为的一种直接打击。
恢复原种植条件： 对于非法占用农耕地进行非农业建设，导致耕地种植条件严重毁坏或者严重污染的，相关部门会责令限期改正或者治理，以恢复原种植条件。这是保护耕地资源、维护生态平衡的重要措施。
行政处分： 对于国家机关工作人员在耕地保护工作中玩忽职守、滥用职权、徇私舞弊的行为，将依法给予行政处分。这是对公职人员的一种监督和约束，旨在确保耕地保护工作的有效进行。
二、刑事责任
非法占用农用地罪： 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法占用农耕地改作他用，数量较大且造成耕地大量毁坏的，将构成非法占用农用地罪。处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。具体而言，“数量较大”是指非法占用基本农田五亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地十亩以上；“造成耕地大量毁坏”则包括在非法占用的耕地上进行建窑、建坟、建房、挖沙、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物等非农业建设活动，导致基本农田五亩以上或基本农田以外的耕地十亩以上种植条件严重毁坏或严重污染。
其他相关罪名： 如果非法占用农耕地的行为同时触犯了其他法律条款，如涉及贪污受贿、渎职等犯罪行为的，还可能受到相应的刑事处罚。这是对非法行为的一种严厉打击，旨在维护法律的尊严和权威。
三、其他法律责任
除了行政责任和刑事责任外，非法占用农耕地的单位或个人还可能需要承担赔偿损失、恢复原状等民事责任。因非法占用农耕地给他人造成损失的，行为人应承担相应的民事赔偿责任。这包括赔偿因耕地被非法占用而导致的农作物损失、土地复垦费用以及其他直接经济损失等。
结论与建议：
非法占用农耕地不仅违法，而且将面临严格的法律制裁，包括行政处罚、刑事制裁以及民事赔偿等。因此，我建议所有单位和个人在使用土地时，必须严格遵守国家法律法规和土地利用规划要求，确保土地的合法使用和保护。通过共同努力，我们可以有效维护国家的耕地资源，保障粮食安全和生态环境的可持续发展。对于二次非法占用农耕地的行为，相关部门将依法从重处罚，以儆效尤。