可以，但需满足法定条件并注意风险防控。个体工商户作为民事主体，依法享有签订工程合同的权利，但需结合法律规范和实务操作进行具体分析：

1. 法律资格层面：个体工商户具备签约主体资格

根据《民法典》第四百六十四条，合同签订主体包括自然人、法人和非法人组织。个体工商户属于《民法典》规定的“非法人组织”，在营业执照核准的经营范围内从事经营活动时，具有签订工程合同的合法资格。
关键点：需确保营业执照中明确登记了“工程施工”“建筑安装”等与工程相关的经营范围。若未登记，可能因“超范围经营”导致合同效力争议。

2. 合同效力层面：需满足工程合同特殊要求

工程合同属于《民法典》规定的“建设工程合同”，受《建筑法》等特别法调整。个体工商户签订工程合同时，需注意：

• 资质要求：若工程涉及建筑施工、装修装饰等需资质的领域（如《建筑业企业资质标准》规定的资质），个体工商户需取得相应资质。若未取得资质或超越资质等级签订合同，可能面临合同无效风险（《建筑法》第二十六条）。
  
• 项目规模限制：部分地区对个体工商户承接工程规模有限制（如单项合同额不超过注册资金5倍），需提前核查地方性法规。
  
• 形式要件：工程合同建议采用书面形式，并明确约定工程范围、工期、质量标准、价款支付等条款（《民法典》第七百八十九条）。

3. 实务操作层面：风险防控建议

• 资质核查：签订前确认自身是否具备工程所需资质，或通过挂靠、分包等方式与有资质的企业合作（需注意挂靠合法性，部分地区禁止个人挂靠）。
  
• 合同条款设计：明确约定违约责任、质量保修期、争议解决方式（如仲裁或诉讼），避免条款模糊导致纠纷。
  
• 税务合规：工程款收入需按“生产经营所得”申报纳税，避免偷逃税款风险。
  
• 证据留存：保存合同原件、付款凭证、验收报告等材料，以备纠纷时举证。

4. 例外情形：禁止个体工商户承接的工程

根据《建筑法》第十四条，以下工程必须由具备相应资质的法人企业承接，个体工商户不得直接签订合同：

• 大型基础设施、公用事业项目；
  
• 涉及国家安全、秘密的项目；
  
• 全部或者部分使用国有资金投资或国家融资的项目。

总结：个体工商户可以与公司签订工程合同，但需确保经营范围包含工程业务、具备相应资质（如需），并严格遵守工程合同法律规范。若对资质要求或合同条款设计有疑问，可直接向我咨询具体操作方案。